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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002468`

染色体: Chr01 坐标: 42401841-42404048 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002468`
名称	SmilChr01G002468
描述	labd-13Z-ene-9,15,16-triol synthase, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	42401841 - 42404048 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025678`
GeneID	`131025678`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025678`
原始查询	`SmilChr01G002468`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	labd-13Z-ene-9,15,16-triol synthase, chloroplastic-like
产物	labd-13Z-ene-9%2C15%2C16-triol synthase%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G12300` (CYP706A4) cytochrome P450, family 706, subfamily A, polypeptide 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826839] identity=46.5; qcov=1; evalue=1.92e-165; confidence=high
Rice	`Os01g0700500` - identity=41.7; qcov=0.841; evalue=4.34e-123; confidence=medium
GO	GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	-
Pfam	PF00067 (p450)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025678

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057811457.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057811457.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811457.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811457.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811457.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:42402203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B7
`Chr1:42402359`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,C1
`Chr1:42402479`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr1:42402492`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B22,B67,B79,C29,C42
`Chr1:42402521`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B26,B80,C38,C60
`Chr1:42402540`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B7,C35
`Chr1:42402549`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,C29
`Chr1:42402554`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B106
`Chr1:42402554`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B106
`Chr1:42402619`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,C7
`Chr1:42402622`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,C7
`Chr1:42402691`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811457.1

510 aa

255

510

p450

PF00067 p450 34-495 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811457.1`	Pfam	`PF00067`	p450	Domain	34	495	2.1e-104	350.6	Cytochrome P450

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955474.1
CGCTATCCAAAACATAATTACGTGTATTAGGTGACTTGAAATCTCAATTATTGATTGCAAAAAACATCTTATTCTTACCAATGCATATTAGGTGACTTGAAATCTCATTTATAGATTGCAAAAAACATCTTATTCTTACAATTGCATATTACCAATATAAGTGCGATTCACGTCTATAAATATGTAAGTTGGAAAATCAATCCTCAAGATAAATATTCACAAATAACCATATTGTGCCATAACCGAGAGAGAGAGAGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025678
ATGGATCCAATTATCTTGGGATCTCTAGTGGTGTCAGTAGTACTAGTAGTAGCATCAATATTGTGGTACAAAACTAGTTCATGGAATCGCGGCCCATTGCCGCCGGGGCCACGGGGAGTTCCCATCCTCGGCTATCTGCCTTTCATGTCCTCCAATATGCTCCAACACTTAACCCATCTGTCTCACCAATACGGCCCTATCTACAAGCTCCGCCTCGGCACCAAACTGGCGGTGGTCATCACCTCGCCGTCCTTGGCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811457.1
MDPIILGSLVVSVVLVVASILWYKTSSWNRGPLPPGPRGVPILGYLPFMSSNMLQHLTHLSHQYGPIYKLRLGTKLAVVITSPSLAKQVLRDQDHIFGHRDPTVAALIYSRGGRDVAFSPPNSSWREMRKVLVRETQSSSALHASRELRRDQVRKAVRSIYSNIGQPVAFGKLAFQTEVSLLMNLMWGGLHSHSAGEERERLATEFKALNSQISKLLGKPNISDLFPFLSIFDLQGVKKQMGKVVDSLDNILEQFISQHE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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