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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002475`

染色体: Chr01 坐标: 42490204-42493779 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002475`
名称	SmilChr01G002475
描述	probable polyamine transporter At3g19553
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	42490204 - 42493779 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025712`
GeneID	`131025712`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025712`
原始查询	`SmilChr01G002475`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable polyamine transporter At3g19553
产物	probable polyamine transporter At3g19553
Arabidopsis	`AT3G19553` (PUT5) Amino acid permease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821492] identity=71.6; qcov=0.958; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0576900` (OsPUT3) - identity=57.3; qcov=0.915; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00324 (AA_permease); PF13520 (AA_permease_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025712

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vesicle	囊泡	0.60000	`XP_057811487.1`
2	Endosome	内体	0.60000	`XP_057811487.1`
3	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.40000	`XP_057811487.1`
4	Lysosome	溶酶体	0.40000	`XP_057811487.1`
5	Lysosome membrane	溶酶体膜	0.40000	`XP_057811487.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:42490440`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	A18,A7,B1,B11,B130,B82,B83,B85,C19,C39,C40,C70,C71,D11
`Chr1:42490451`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B2
`Chr1:42490606`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:42490726`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr1:42490746`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:42492762`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr1:42492817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,B46
`Chr1:42492822`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr1:42492825`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	C58,D10,D6
`Chr1:42492825`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	3	C58,D10,D6
`Chr1:42492845`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	16	A21,A4,B115,B118,B15,B22,B74,B76,B86,C18,C40,C41,C44,C54,C73,C75
`Chr1:42492860`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,C2,C23,C25,C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811487.1

504 aa

252

504

AA_permease_2

AA_permease

PF13520 AA_permease_2 27-408 aa PF00324 AA_permease 48-416 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811487.1`	Pfam	`PF13520`	AA_permease_2	Family	27	408	1.4e-31	110.5	Amino acid permease
`XP_057811487.1`	Pfam	`PF00324`	AA_permease	Domain	48	416	4.5e-15	56.0	Amino acid permease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955504.1
CGCACGTGTAAACTAACCGTTACACGTGTGCGGCCTGGAGGTAGAATTATCGTAAATCATGTGCTCTCTGAATCAAGTCAAACCAAACCACCATAACCAAATCCAACTCATTTCATATGAATCTTCTGGTTTCGTGATCGCCCATCTTCCCCCCATTCTCTTCCTGTTATCAGCTATTCCCACGTTACTCGTCACTGATCCTCTCTCCCCCTCTCTCTCCCTCCCTCTGTCTCTATGGGTGAGAACAAGGAGGGGGAGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025712
ATGGGTGAGAACAAGGAGGGGGAGGAGGGATTAATGGCGAATTCCACCAAGCCAAACCCAAAGCTGACAATACTGCCTCTGATCGCCTTGATTTTCTACGAGGTCTCCGGCGGCCCCTTCGGAGTCGAGGACTCCGTGAGAGCAGGCGGCGGCCCTCTCCTCTCTCTCCTAGGTTTCCTGATTTTCCCCTTCTTCTGGAGCATCCCGGAAGCCCTAGTCACCGCGGAGCTCGCCACCAGTTTCCCGGAAAACGGCGGCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811487.1
MGENKEGEEGLMANSTKPNPKLTILPLIALIFYEVSGGPFGVEDSVRAGGGPLLSLLGFLIFPFFWSIPEALVTAELATSFPENGGYVLWISSAFGPFWGFQEGFWKWFSGVMDNALYPVLFLDYLKHSFPIFNQTMARIPALLGITMSLTYLNYRGLHIVGFSAVLLACFSLVPFVVMGVLSIPRIRPRRWLVVDYGKVEWRGYFNSLFWNLNYWDNASTLAGEIENPSRTFPRALLGAVVVVVCSYLVPLLAGTGAVE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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