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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002490`

染色体: Chr01 坐标: 42615577-42619485 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002490`
名称	SmilChr01G002490
描述	uncharacterized SmilChr01G002490
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	42615577 - 42619485 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025794`
GeneID	`131025794`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025794`
原始查询	`SmilChr01G002490`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0134900; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0134900; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G22740` (AT4G22740) glycine-rich protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828370] identity=48.7; qcov=0.786; evalue=5.15e-69; confidence=high
Rice	`Os06g0134900` - identity=50.7; qcov=0.857; evalue=5.81e-87; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10248 (Mlf1IP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025794

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057811568.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057811568.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057811568.1`
4	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057811568.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811568.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:42615882`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B13
`Chr1:42616006`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B2,B24,B73,B76,D2
`Chr1:42616020`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B109
`Chr1:42616448`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B74,C28,D11
`Chr1:42616455`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B98,C43,C48
`Chr1:42616521`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C28
`Chr1:42616958`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:42617094`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B137,B19
`Chr1:42617308`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B130,B24,B85,D11
`Chr1:42617309`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B30,B89
`Chr1:42617383`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,C2,C4
`Chr1:42617389`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B98,C43,C48,C65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811568.1

350 aa

175

350

Mlf1IP

PF10248 Mlf1IP 118-262 aa

XP_057811574.1

350 aa

175

350

Mlf1IP

PF10248 Mlf1IP 118-262 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811568.1`	Pfam	`PF10248`	Mlf1IP	Family	118	262	1.1e-20	75.1	Myelodysplasia-myeloid leukemia factor 1-interacting protein
`XP_057811574.1`	Pfam	`PF10248`	Mlf1IP	Family	118	262	1.1e-20	75.1	Myelodysplasia-myeloid leukemia factor 1-interacting protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955585.1
ATCCTAATCCAGCGCCACTTCTCTCTTCTTCTTCATCTTGGGTTTTTTCCTTTTCCTCCATTTTCTTTCTCTATTTGATCTGGCGTTTTTTTCTTCCTTTTTGTTTTACTTTTCATTTTCTATCTCTTCTTCATCTTGCGTTCTTCCTACATCTTTTTCTTCCTTTCATCATCCTGCAAATTTTTCTTAATTCCTATAAACAATGGATGTGAAATTTTAAAGTAGAGTGTGTCGATAGCCCCAAATTGGAGTTGAACACG...

XM_057955591.1
AGCAATTTAAGGAAAGATAAAATTTTTATGGATTAATAGGCTGTTTAAAGCCTAGCGCGATATTTTTTGGTGCTACCAGAAACTTCTTAAAATTTACCTTTCTGCATCTAATAGCGTTTCATTTATCTACTTCGATTCGCAAATTCAGTTACATCTCAAAATCTGCAGAATCGAAGTTTTCGTCCATCTCTTTTTCGCTATCAAATTAGTCGCTTTTTCAGGGGAGCTAGCATCTAGAAATGCAGGGAGGTAGAGGCCCA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131025794
ATGCAGGGAGGTAGAGGCCCATTCTTTGGTTTTGGGGACCCTTTTGGTGGTTTTGGTGGATTTGGTGGCTTTGGACGTCAAAGGAGTATGATTTCTGAGTTTTTTGGGGGAAGGGATCCATTTGATGATCCCTTTTTCAGGAGCCCTTTTGGGGGAGTGTTTGAGTCTAGCCTTTTTGGCTCTAATGGAGGTCCATTTATGAATCCTCATGCTTCTGGATTCCTTCAACATCTGCCACCCGCCCCGCCCCAACCTAATCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057811568.1
MQGGRGPFFGFGDPFGGFGGFGGFGRQRSMISEFFGGRDPFDDPFFRSPFGGVFESSLFGSNGGPFMNPHASGFLQHLPPAPPQPNLSRGPVMSRGPVIEELNSDDEEDEKESGKMNKENPRKHRRSSKGPIVEDPDDEATEKKSKYMTSRNDMNQMQHARLQPEVNSFTFQSSSVSYGGANGAFYTTSSTRRTGSDGLTYEEFKEADSSTRQATHRVGRAIHDKGHSVTRKLKSDGHVDTMQTLHNLNQDELPCFEDAW...

XP_057811574.1
MQGGRGPFFGFGDPFGGFGGFGGFGRQRSMISEFFGGRDPFDDPFFRSPFGGVFESSLFGSNGGPFMNPHASGFLQHLPPAPPQPNLSRGPVMSRGPVIEELNSDDEEDEKESGKMNKENPRKHRRSSKGPIVEDPDDEATEKKSKYMTSRNDMNQMQHARLQPEVNSFTFQSSSVSYGGANGAFYTTSSTRRTGSDGLTYEEFKEADSSTRQATHRVGRAIHDKGHSVTRKLKSDGHVDTMQTLHNLNQDELPCFEDAW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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