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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002502`

染色体: Chr01 坐标: 42878305-42884957 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002502`
名称	SmilChr01G002502
描述	protein cornichon homolog 4
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	42878305 - 42884957 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025893`
GeneID	`131025893`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025893`
原始查询	`SmilChr01G002502`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein cornichon homolog 4
产物	protein cornichon homolog 4
Arabidopsis	`AT1G12390` (AT1G12390) Cornichon family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837794] identity=75; qcov=0.978; evalue=1.16e-72; confidence=high
Rice	`Os12g0506400` (OsCNIH2) - identity=50.8; qcov=0.935; evalue=2.34e-42; confidence=medium
GO	GO:0016192 (vesicle-mediated transport)
KEGG	-
Pfam	PF03311 (Cornichon)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025893

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057811656.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057811656.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057811656.1`
4	Endoplasmic reticulum-golgi intermediate compartment	Endoplasmic reticulum-golgi intermediate compartment	0.20000	`XP_057811656.1`
5	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057811656.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:42880226`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811656.1

139 aa

139

Cornichon

PF03311 Cornichon 5-125 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811656.1`	Pfam	`PF03311`	Cornichon	Family	5	125	3.9e-46	157.0	Cornichon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955673.1
ACTAATAAGACGAATACTGGCACTGCTAATCTCAAATTTGGTTCGTTTCACCAAATAAGTTGGAATGATTTTTTATTAAACAACTAATGAATAGGTTGATTTATTTACATATCTAATTGAGTTTATTAAAATGAAATTTTTATTTGAGCTATAAAGCTAAAGTAACACCTGAATGCGGCACCTGAAATTCCTCGTCTTTTCCTCCGCCGATAGGGTTTCGATTCCGGTCATCTCTGATTCCTTTCTTTCGCCGGCGGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025893
ATGGGAGAGGTGTTGGCATGGCTGCTCTTCTTCTTCATACTTATTGCTCTCCTCGTTATGATCGTTTTCCAGCTAATGTGCTTGGCGGATTTAGAGTTTGATTACATCAATCCTTATGATTCTGCGTCTCGAATAAATAAAGTAGTTTTACCAGAGTTCATCACGCAAGGAGTTCTGTGCTTCCTCTTCCTTGTCACCGGACATTGGTTTATGTCGCTTCTCTGTGTCCCATACCTGTACTACAACGTGAGATTGTACCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811656.1
MGEVLAWLLFFFILIALLVMIVFQLMCLADLEFDYINPYDSASRINKVVLPEFITQGVLCFLFLVTGHWFMSLLCVPYLYYNVRLYLQRQHLVDVTEIFNLLNWEKKERLFKLGYIILLLFMCLFWMIYNALEDDEHSF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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