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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002505`

染色体: Chr01 坐标: 42933039-42935159 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002505`
名称	SmilChr01G002505
描述	uncharacterized SmilChr01G002505
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	42933039 - 42935159 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008377`
GeneID	`131008377`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008377`
原始查询	`SmilChr01G002505`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0537000; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os12g0537000; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G15020` (AT4G15020) hAT transposon superfamily [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827161] identity=33.8; qcov=0.814; evalue=8.66e-54; confidence=low
Rice	`Os12g0537000` - identity=35.1; qcov=0.699; evalue=1.78e-61; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04937 (DUF659)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008377

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791246.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057791246.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791246.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791246.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791246.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:42933096`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D10
`Chr1:42933111`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D10
`Chr1:42933148`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr1:42933149`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B127,B94,C50,C84
`Chr1:42933162`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B9
`Chr1:42933283`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B7
`Chr1:42933352`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D10
`Chr1:42933359`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	A2,A23,A4,B100,B123,B133,B30,B6,B73,C19,C47,C7
`Chr1:42933372`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A2,A4,B123,B30,B73,C19,C47
`Chr1:42933426`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B78,B83,C15,C53,C73
`Chr1:42933449`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	93	A13,A14,A16,A20,A25,A6,A7,A9,B106,B107,B117,B118,B121,B122,B123,B124,B128,B131,B132,B134,B137,B138,B14,B17,B18,B19,B20,B23,B26,B27,B3,B30,B34,B38,B39,B40,B5,B51,B52,B54,B55,B57,B59,B63,B65,B66,B68,B69,B70,B72,B74,B75,B78,B80,B82,B88,B89,B91,B93,C11,C13,C15,C16,C18,C20,C22,C28,C3,C30,C31,C33,C38,C40,C41,C42,C46,C5,C52,C54,C57,C60,C62,C65,C69,C71,C72,C78,C82,C85,D10,D4,D7,D8
`Chr1:42933464`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791246.1

469 aa

234

469

DUF659

PF04937 DUF659 129-258 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791246.1`	Pfam	`PF04937`	DUF659	Domain	129	258	4.5e-46	156.9	Domain of unknown function (DUF659)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935263.1
ATGAAGGAGTATTTGAGAGCATTTGAGGAATCAAAACACTCCAAACAACGAGAATTCGATGATATGGTAGATGGTGGAGCCTATTTTGGTGTTGATATGTCCAAAGATTCGTTCCTAGCCGGCGTCGAGAGAGGTAGCAGAGGGTCTATGGATCAATTTCTTACTAATGAGTTAGAAGATGGCAAAGTAGTTCCTCCAAGTGCAACGGCTAAAGAGCATCGTAGTCGAGTTTGTCTAGATATTGGGAGGTTCTTCTTTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008377
ATGAAGGAGTATTTGAGAGCATTTGAGGAATCAAAACACTCCAAACAACGAGAATTCGATGATATGGTAGATGGTGGAGCCTATTTTGGTGTTGATATGTCCAAAGATTCGTTCCTAGCCGGCGTCGAGAGAGGTAGCAGAGGGTCTATGGATCAATTTCTTACTAATGAGTTAGAAGATGGCAAAGTAGTTCCTCCAAGTGCAACGGCTAAAGAGCATCGTAGTCGAGTTTGTCTAGATATTGGGAGGTTCTTCTTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791246.1
MKEYLRAFEESKHSKQREFDDMVDGGAYFGVDMSKDSFLAGVERGSRGSMDQFLTNELEDGKVVPPSATAKEHRSRVCLDIGRFFFENAIPFNCIRSSSFVSMMRSIGGYGRGLKPPSMHEMRTWILKDEIKATWKHTGVSLLSDGWSDMRNRSLINFLVNNQYGTVYLKTVDESDVVKNAQKLFELLDEVVEEIEEGHVVQVITDNAVAYKAVGRLLMEKRTSLYWTSYAAHCIDLIIEKIGELPQHKNALLKAKRVTN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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