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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002512`

染色体: Chr01 坐标: 43025927-43027437 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002512`
名称	SmilChr01G002512
描述	AT-hook motif nuclear-localized protein 26-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	43025927 - 43027437 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026005`
GeneID	`131026005`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026005`
原始查询	`SmilChr01G002512`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT-hook motif nuclear-localized protein 26-like
产物	AT-hook motif nuclear-localized protein 26-like
Arabidopsis	`AT4G22810` (AT4G22810) Putative AT-hook DNA-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828380] identity=56.2; qcov=1.12; evalue=1.12e-80; confidence=high
Rice	`Os02g0448000` - identity=57; qcov=1.06; evalue=3.2e-88; confidence=high
GO	GO:0003680 (minor groove of adenine-thymine-rich DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0010228 (vegetative to reproductive phase transition of meristem)
KEGG	-
Pfam	PF03479 (PCC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026005

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811770.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811770.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811770.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811770.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811770.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:43026533`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B127,B73,C20,D11,D4
`Chr1:43026758`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B32,C78
`Chr1:43026785`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C78
`Chr1:43026815`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr1:43026896`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C78
`Chr1:43026902`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B58,C26,C36
`Chr1:43027035`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B138,B56,B90
`Chr1:43027052`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:43027108`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B125
`Chr1:43027129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,B85
`Chr1:43027130`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B125
`Chr1:43027154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B127,C20,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811770.1

279 aa

140

279

PCC

PF03479 PCC 94-211 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811770.1`	Pfam	`PF03479`	PCC	Domain	94	211	5.3e-33	114.4	Plants and Prokaryotes Conserved (PCC) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955787.1
CATAAATAATTTCATTATTTTAATTAATCATACAATTTTATGATGCAGCAGCTCTTATTATTACACTTGATATGTGCGTGCGTGCGTGCGCCTGTGTGTGAGAGAGAAGACAGAGGGGAGAGAGAGAGAGAAGAAGTAGTCTTGTTTTCCGAAATCAAACCCTAATCCAAAGTCTTTGAGATCCAAGAAGACAACCCCCAGCTCATATATCCTCCTCAGATCAGACACTACCACATATAGCATAGATCTCAGCTCAACGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026005
ATGGATAATCACTCACTGCCGCCGCCGTTCCACACAAGGGATCACTTCAACCTGCAGCACCAATTCCACCAGCAGAATTCCGAAGACGAGCAGAGCGACTCCCCCGGCGGCCTAAACATGGGGCTGAAGCGCGCCCTCGACGACGGCAAGAGCGACTCCGCCGGCAAAGACGGCGGCAGCGGCTCCGCGGCCGAGGGCGACATGTCGGCCAGCCGGCGCCCGCGGGGCCGCCCCGCCGGATCCAAGAACAAGTCGAAGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811770.1
MDNHSLPPPFHTRDHFNLQHQFHQQNSEDEQSDSPGGLNMGLKRALDDGKSDSAGKDGGSGSAAEGDMSASRRPRGRPAGSKNKSKPPIIISRDSANALRTHVMEVADGGDIMDAVASFARSRQRGVCIMSGTGSVTNVTLRQPASPGAVVTLHGRFEILSLAGSFLPPPAPPTATGLTVYLAGGQGQVVGGSVAGQLLASGPVIIMAASFSNAAYERLPLENEENGIGGQGNSLGSPPQQAPPQMMADPSLFQGMPPNL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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