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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002524`

染色体: Chr01 坐标: 43213119-43215401 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002524`
名称	SmilChr01G002524
描述	protein FAR-RED IMPAIRED RESPONSE 1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	43213119 - 43215401 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008417`
GeneID	`131008417`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008417`
原始查询	`SmilChr01G002524`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR-RED IMPAIRED RESPONSE 1-like
产物	protein FAR-RED IMPAIRED RESPONSE 1-like
Arabidopsis	`AT4G15090` (FAR1) FRS (FAR1 Related Sequences) transcription factor family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827173] identity=32.8; qcov=0.746; evalue=1.13e-100; confidence=low
Rice	`Os11g0681300` - identity=36; qcov=0.853; evalue=1.11e-141; confidence=medium
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF10551 (MULE); PF21056 (ZSWIM1-3_RNaseH-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008417

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791284.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791284.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791284.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791284.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791284.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:43213286`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B109,B120,B31,C24
`Chr1:43213296`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr1:43213381`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr1:43213396`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr1:43213413`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr1:43213415`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A23,B10,B56,B96,C20
`Chr1:43213415`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A23,B10,B56,B96,C20
`Chr1:43213500`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:43213534`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B133,C19,C52
`Chr1:43213554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A3,B133,C19,C52,D3
`Chr1:43213554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B133,C19,C52,D3
`Chr1:43213570`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	90	A1,A11,A23,A25,A6,B10,B108,B110,B111,B112,B114,B122,B127,B133,B134,B135,B136,B16,B19,B2,B21,B23,B24,B32,B33,B34,B37,B41,B46,B50,B51,B53,B54,B56,B57,B58,B62,B63,B64,B68,B69,B71,B73,B76,B84,B86,B9,B93,B95,B96,C12,C13,C19,C20,C21,C22,C25,C26,C30,C33,C35,C37,C38,C4,C40,C48,C49,C51,C53,C54,C61,C62,C63,C64,C66,C7,C70,C71,C73,C74,C76,C81,C82,C84,C86,D3,D4,D5,D6,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791284.1

760 aa

380

760

FAR1

ZSWIM1-3_RNaseH-like

MULE

PF03101 FAR1 95-165 aa PF21056 ZSWIM1-3_RNaseH-like 252-367 aa PF10551 MULE 286-379 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791284.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	95	165	4.5e-08	34.4	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057791284.1`	Pfam	`PF21056`	ZSWIM1-3_RNaseH-like	Domain	252	367	7.4e-07	29.9	Zinc finger SWIM domain-containing protein 1/3, RNaseH-like domain
`XP_057791284.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	286	379	2.7e-28	98.9	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935301.1
ATGGAAGAGCTAGATGCAGCAAGAAGAGCTAAGATGCATGAGCTTTTCGGCGAAGATTTAGAAGACTCGGACGAAATTTCAGATCAAAATGGAGAAGACCTTTTCGGCGAAGATGGAATAGTTTCACACGAGGTTTTAGATCAAGATGAAGAAGAGCAACATGAGAACACGGAGGAGGACGAAGATTTATTTGGAGTTGATTGGCTGGCATGTGAGAAGATGATGCAGAATGGTCCGCAACCTGGTTTGGAATTTGAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008417
ATGGAAGAGCTAGATGCAGCAAGAAGAGCTAAGATGCATGAGCTTTTCGGCGAAGATTTAGAAGACTCGGACGAAATTTCAGATCAAAATGGAGAAGACCTTTTCGGCGAAGATGGAATAGTTTCACACGAGGTTTTAGATCAAGATGAAGAAGAGCAACATGAGAACACGGAGGAGGACGAAGATTTATTTGGAGTTGATTGGCTGGCATGTGAGAAGATGATGCAGAATGGTCCGCAACCTGGTTTGGAATTTGAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791284.1
MEELDAARRAKMHELFGEDLEDSDEISDQNGEDLFGEDGIVSHEVLDQDEEEQHENTEEDEDLFGVDWLACEKMMQNGPQPGLEFENRDSLFTAYQAFAKVAGFSVSTRNKRDRYLMISCERARKPNAKKYTKKMNCPARLNAIKQDNGKWKVSTVCNEHNHELEPHMSEFMPAHRHLSTNLKVHLDAYDRAGLRLCKSVRMMEVLAGGPPNLGASMKDCRNYVDKMRKLRLGDGDAAAIQQLFKRLQQNDKDFFYLVDI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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