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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002536`

染色体: Chr01 坐标: 43424648-43428416 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002536`
名称	SmilChr01G002536
描述	copper chaperone for superoxide dismutase, chloroplastic/cytosolic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	43424648 - 43428416 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026352`
GeneID	`131026352`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026352`
原始查询	`SmilChr01G002536`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	copper chaperone for superoxide dismutase, chloroplastic/cytosolic
产物	copper chaperone for superoxide dismutase%2C chloroplastic/cytosolic
Arabidopsis	`AT1G12520` (CCS) copper chaperone for SOD1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837808] identity=63.6; qcov=0.858; evalue=9e-132; confidence=high
Rice	`Os04g0573200` (SOD) - identity=72.9; qcov=0.694; evalue=5.51e-121; confidence=high
GO	GO:0004784 (superoxide dismutase activity); GO:0005507 (copper ion binding); GO:0019430 (removal of superoxide radicals)
KEGG	-
Pfam	PF00080 (Sod_Cu); PF00403 (HMA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026352

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057812197.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057812197.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812197.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812197.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812197.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:43424927`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B10,B125,B132,B92
`Chr1:43424979`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr1:43425070`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B1,B35,B7,B76
`Chr1:43426087`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr1:43426092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,B59
`Chr1:43428187`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,B59
`Chr1:43428241`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C13
`Chr1:43428241`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C13
`Chr1:43428310`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B132
`Chr1:43428310`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B132

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812197.1

330 aa

165

330

HMA

Sod_Cu

PF00403 HMA 104-159 aa PF00080 Sod_Cu 187-287 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812197.1`	Pfam	`PF00403`	HMA	Domain	104	159	3.8e-13	50.3	Heavy-metal-associated domain
`XP_057812197.1`	Pfam	`PF00080`	Sod_Cu	Domain	187	287	2.5e-18	67.5	Copper/zinc superoxide dismutase (SODC)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956214.1
AAGTAGAACTGTAGAAGTTGCGGGAGACTAAAGAAATAGGCAGCATCAGCTGTCATAAAGGGGAAAGAAAAATGGCATTTTTGAGGTCAGTAGTCGCCACAACAACTACAGCCGTAGCAGCAGCCACAGTTGCAATTCCAGCCGTCTTCGCTATCCCTTCAGTCGCATCCTCTCCTTCATCTTCACAGTCTTCCACTTCTTTCAAAGGGGTATCCAAAAACCCATTTTTCGGGTCGCTCAATCTGTCTGCCAACCCGATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026352
ATGGCATTTTTGAGGTCAGTAGTCGCCACAACAACTACAGCCGTAGCAGCAGCCACAGTTGCAATTCCAGCCGTCTTCGCTATCCCTTCAGTCGCATCCTCTCCTTCATCTTCACAGTCTTCCACTTCTTTCAAAGGGGTATCCAAAAACCCATTTTTCGGGTCGCTCAATCTGTCTGCCAACCCGATTTGCGGACCCAAAAAATCGGGCCTCCTGCAAGCTGTAACGAACCTGCCTTCTGTTTCTGTCGAAATGGATCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812197.1
MAFLRSVVATTTTAVAAATVAIPAVFAIPSVASSPSSSQSSTSFKGVSKNPFFGSLNLSANPICGPKKSGLLQAVTNLPSVSVEMDPEQSTQNGAVLPELLTEFMVDMKCEGCVNSVRNKLQTVDGVKKVDVDLTNQVVRVLGNSPVKILTEALDQTGRKARLIGQGLPDDFLVSAAVAEFKGPSIYGVVRLAQVNMELARIEANFSGLPPGKHGWSINQFGDLTKGAASTGKVFNPLKDEKEAVGDLGTLEVDEKGEAF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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