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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002545`

染色体: Chr01 坐标: 43537481-43540010 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002545`
名称	SmilChr01G002545
描述	subtilisin-like protease
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	43537481 - 43540010 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026094`
GeneID	`131026094`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026094`
原始查询	`SmilChr01G002545`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	subtilisin-like protease
产物	subtilisin-like protease
Arabidopsis	`AT3G14067` (AT3G14067) Subtilase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820621] identity=44.8; qcov=1.02; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os03g0119300` (OsSub25) - identity=50.1; qcov=0.953; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00082 (Peptidase_S8); PF02225 (PA); PF05922 (Inhibitor_I9); PF17766 (fn3_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026094

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057811852.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057811852.1`
3	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057811852.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811852.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811852.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:43537673`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B107,B85,C39,C86
`Chr1:43537769`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:43537815`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr1:43538083`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C61,C65
`Chr1:43538437`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr1:43538660`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,C33,C41,C46
`Chr1:43538937`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C81
`Chr1:43538937`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C81
`Chr1:43539128`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B53,B6,B86,C44,C67
`Chr1:43539251`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr1:43539272`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr1:43539374`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811852.1

762 aa

381

762

Inhibitor_I9

Peptidase_S8

fn3_6

PF05922 Inhibitor_I9 48-130 aa PF00082 Peptidase_S8 153-578 aa PF02225 PA 372-460 aa PF17766 fn3_6 655-753 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811852.1`	Pfam	`PF05922`	Inhibitor_I9	Domain	48	130	3.2e-14	54.1	Peptidase inhibitor I9
`XP_057811852.1`	Pfam	`PF00082`	Peptidase_S8	Domain	153	578	3.4e-47	161.8	Subtilase family
`XP_057811852.1`	Pfam	`PF02225`	PA	Domain	372	460	2.1e-13	50.9	PA domain
`XP_057811852.1`	Pfam	`PF17766`	fn3_6	Domain	655	753	2e-29	102.4	Fibronectin type-III domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955869.1
GGATCATGAGAGCACTATGTAGTGTGGAAATTTTTTAGTGGTGGACTTGAAAAGTGGGTCGTTCAGAAATGGTAGCCCCTCACCGATTTCACCCAAGGCACACGTTTCACGAAATCAACTTCTATAAGAGCTAGGTAGATGACGAGGAATCCACACAGCAATACCAATTCACAAATTAACATGGCATTCCTATCCACTACAATCACCATTCTTTGTATATTCTGCATCACTAGACTGCCTAGATTTGCATCTGAGATACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026094
ATGACGAGGAATCCACACAGCAATACCAATTCACAAATTAACATGGCATTCCTATCCACTACAATCACCATTCTTTGTATATTCTGCATCACTAGACTGCCTAGATTTGCATCTGAGATACCACATAGAAACAGTTTGCAAACTTACATTGTTCATGTTGAGGCACCTGATGCACACCTCACGTCTCAATCCGAAGATTTGGAGAGCTGGTACCGCTCTTTTCTCCCGGCTACGACAGCAAGCTCGAGTGAGGGCGAGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811852.1
MTRNPHSNTNSQINMAFLSTTITILCIFCITRLPRFASEIPHRNSLQTYIVHVEAPDAHLTSQSEDLESWYRSFLPATTASSSEGEPRLVYSYRHVFKGFAARLSPEQVKDMEKKQGFVSARPQKSMSLHTTHSPNFLGLNQNMGFWKTSNYGKGVIIGMLDTGVLPEHPSFSDKGMPPPPPKWKGKCQFNHTKCNNKIIGARYFYAEDQSPLDDDGHGTHTASTAAGNFVQGANLFGNANGTAAGVAPYAHLAIYKVCC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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