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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002553`

染色体: Chr01 坐标: 43644592-43645904 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002553`
名称	SmilChr01G002553
描述	protein STAY-GREEN homolog, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	43644592 - 43645904 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026493`
GeneID	`131026493`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026493`
原始查询	`SmilChr01G002553`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein STAY-GREEN homolog, chloroplastic-like
产物	protein STAY-GREEN homolog%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G22920` (NYE1) non-yellowing 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828391] identity=60.9; qcov=0.963; evalue=1.38e-97; confidence=high
Rice	`Os09g0532000` (SGR) - identity=70.6; qcov=0.702; evalue=7.95e-86; confidence=high
GO	-
KEGG	smil00860 (Porphyrin metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF12638 (Staygreen)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026493

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057812346.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057812346.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057812346.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057812346.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812346.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:43644759`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr1:43644770`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A3,B35,B76
`Chr1:43644770`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A3,B35,B76
`Chr1:43644779`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B35
`Chr1:43644779`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B35
`Chr1:43644786`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B108
`Chr1:43644786`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B108
`Chr1:43645244`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B121
`Chr1:43645333`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B7
`Chr1:43645684`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B7
`Chr1:43645690`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B59,C14,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812346.1

242 aa

121

242

Staygreen

PF12638 Staygreen 54-203 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812346.1`	Pfam	`PF12638`	Staygreen	Domain	54	203	1.5e-54	184.6	Staygreen protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956363.1
AAGCAAGAGAAGCTCTCAAATCTATTTTAAGCAGCAGCGCCCCTTATTTTTTTTCTTCATTCCCTTCAATTCGATTCCACATTCACAAGCATAATTAAGTTATCTTCTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTTTCTTCCTTGATATGGTGACATTAGAAACAGCTTTACTTCCATCAAAGCTAAGGCTGTCGTCCCCGCCCTTTACACAAGAAAATTGCTCTTCCTTTCTTCGCAGTGCCTCTAGAAAATACAAGAAGTATGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026493
ATGGTGACATTAGAAACAGCTTTACTTCCATCAAAGCTAAGGCTGTCGTCCCCGCCCTTTACACAAGAAAATTGCTCTTCCTTTCTTCGCAGTGCCTCTAGAAAATACAAGAAGTATGAAACCCTAGTCCCAGTGGCAAGGCTGTTGGGGCCTGCAGTTTTTGAGGCATCAAAGCTTAAAGTCGTGTATGTTAATAGTGATGAAGAAAAGTTGCAGCCACCAAAACTTCCGAGAACTTATACACTTACACACTGTGATCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812346.1
MVTLETALLPSKLRLSSPPFTQENCSSFLRSASRKYKKYETLVPVARLLGPAVFEASKLKVVYVNSDEEKLQPPKLPRTYTLTHCDLTAKLTLAISESINTRQLQGWYNRLQRDEVVGVWRKIKGKMSLHVHCHISGGHFLLDILAKLRYQIFCKELPMVLKAFVHGDEKLFKKYPEMEEALAWIYFHSNIPEFNRVECWGPLYLATGGPHNHNIHDMHHQPCQHCCTCCTPNVSKPPGPTL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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