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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002583`

染色体: Chr01 坐标: 43965257-43966611 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002583`
名称	SmilChr01G002583
描述	uncharacterized SmilChr01G002583
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	43965257 - 43966611 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008500`
GeneID	`131008500`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008500`
原始查询	`SmilChr01G002583`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0256400; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os11g0256400; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT5G15685` (AT5G15685) mutator transposase MUDRA protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28721163] identity=40.8; qcov=0.138; evalue=5.32e-06; confidence=weak
Rice	`Os11g0256400` - identity=47.7; qcov=0.248; evalue=6.46e-23; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10551 (MULE); PF26130 (PB1-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008500

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791356.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057791356.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057791356.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791356.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791356.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:43965420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,B68,C83
`Chr1:43965454`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C63
`Chr1:43965580`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr1:43965599`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B32,B74,B94
`Chr1:43965625`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:43965647`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B50,B8,B84,C37,C38
`Chr1:43965656`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,D1
`Chr1:43965657`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B50,B8,B84,C38
`Chr1:43965718`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr1:43965722`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B8,C5
`Chr1:43965741`	`TG`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B66,C58,C75
`Chr1:43965751`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,C15,C39,C4,C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791356.1

355 aa

178

355

PB1-like

MULE

PF26130 PB1-like 5-100 aa PF10551 MULE 246-314 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791356.1`	Pfam	`PF26130`	PB1-like	Domain	5	100	1.8e-16	61.0	PB1-like domain
`XP_057791356.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	246	314	1e-08	36.2	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935373.1
ATGGGTGGAAGTGATAACTTCTCACTATTCGTTCATCATGGTGGAGAGTTCCGTGAAGTTCAGGGCTTTGATGCTTATGGTGGGGGTAAAAAGGTAGGGTTTCATGACCTTGATGTAGATAAGTTTGGTTTTTTTGATTTGAAGGATTTAGTGGAGAGTTTGGGTTATTCTGGATGGGCTAAGTTAGTCCATGTCAAACCTAAATCATATGTATTTAGGGTAATCAAAACCGATAAAGAGGTGATGGATATGTTGGGTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008500
ATGGGTGGAAGTGATAACTTCTCACTATTCGTTCATCATGGTGGAGAGTTCCGTGAAGTTCAGGGCTTTGATGCTTATGGTGGGGGTAAAAAGGTAGGGTTTCATGACCTTGATGTAGATAAGTTTGGTTTTTTTGATTTGAAGGATTTAGTGGAGAGTTTGGGTTATTCTGGATGGGCTAAGTTAGTCCATGTCAAACCTAAATCATATGTATTTAGGGTAATCAAAACCGATAAAGAGGTGATGGATATGTTGGGTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791356.1
MGGSDNFSLFVHHGGEFREVQGFDAYGGGKKVGFHDLDVDKFGFFDLKDLVESLGYSGWAKLVHVKPKSYVFRVIKTDKEVMDMLGFLTDVNRVVSVFVEGEIRKSDVGAVDEGDAGAVDQGDAGEGEDDQGDDGEDAEGDVGEGEDDQGDAGEGEDAEEGTYEPSLKDLLSNLPTIDLSGGDWVLERYDGGLTTDSEEEYLPSNAEESDDADDDNREGLDDDNREGLEDEGYVAVKKKQRERMGTSAIAWGVVSVENEV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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