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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002595`

染色体: Chr01 坐标: 44133782-44137281 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002595`
名称	SmilChr01G002595
描述	calcium-dependent protein kinase 26
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	44133782 - 44137281 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130984989`
GeneID	`130984989`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130984989`
原始查询	`SmilChr01G002595`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	calcium-dependent protein kinase 26
产物	calcium-dependent protein kinase 26
Arabidopsis	`AT1G12580` (PEPKR1) phosphoenolpyruvate carboxylase-related kinase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837815] identity=55.6; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0584600` (OsCDPK13) calcium-dependent protein kinase 13-like [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:4336783] identity=50.8; qcov=0.526; evalue=4.4e-86; confidence=medium
GO	GO:0004683 (calcium/calmodulin-dependent protein kinase activity); GO:0005516 (calmodulin binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0009931 (calcium-dependent protein serine/threonine kinase activity); GO:0018105 (peptidyl-serine phosphorylation); GO:0035556 (intracellular signal transduction); GO:0046777 (protein autophosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130984989

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057763693.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057763693.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057763693.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763693.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763693.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:44134857`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr1:44135062`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B98
`Chr1:44135062`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B98
`Chr1:44135174`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr1:44135258`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,B52,C2,C34,C36
`Chr1:44135736`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:44136305`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr1:44137054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763693.1

506 aa

253

506

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 37-293 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 39-289 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763693.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	37	293	3.5e-73	246.9	Protein kinase domain
`XP_057763693.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	39	289	1.4e-29	104.0	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907710.1
ATAAAAATCATCAGTCGAAAATTACGGACAGCTCAATTTCTTCATACAGAAAGCAATTGAAACAACCGGCATTTCCGGTTCTCGGTTACTGAACATTAAAGTGAGTCTTTTTTGAAGTGCAGTTTTTTGAGTAGAGAGTTTGAAAGAGGCTGAGAGAGTTGTGGATTTTGGGCTGCTGCCTCCAACGGAAATCTTCTTCCTCATCGCCTCTTCTCCTCTCTCACCGTCTCCCTCCAATCCCAGGAATTACTATGTCCCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130984989
ATGGGTAGTAGGGAGATGACTCTGACTCATCCTTTTAAATGTTATAAATCTTCGGATATGAGCAAAACGATCTTGAATTTGAGCCAGATCGGTAATTTTAGGGAGCGGTATGTGCTTGGAGATCAGTTAGGATGGGGAAGATTTGGAATTATAAGAGAATGTTCTGATAAGTTGACAGGCGAAGTTTTGGCTTGCAAGTCTATTGCTAAGGAGAGATTGGTTACGGAGGATGATGTTTGGAGTGTGAAGCTTGAGATTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763693.1
MGSREMTLTHPFKCYKSSDMSKTILNLSQIGNFRERYVLGDQLGWGRFGIIRECSDKLTGEVLACKSIAKERLVTEDDVWSVKLEIDILTKLSGHENVVDLKAVYEEEDYVHLLMELCAGGELFHRIEQQGRLSEHEAHVIFKQLMEVLMYCHDKCIVHRDLKPENILLVSRSSSTIKLADFGLATHIEPGNALHGTVGSPFYIAPEVLAGDYNQAADVWSAGVILYILLSGIPPFWGKTKSTIFDAVRAANLCFYSDIW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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