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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002607`

染色体: Chr01 坐标: 44256682-44260723 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002607`
名称	SmilChr01G002607
描述	uncharacterized SmilChr01G002607
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	44256682 - 44260723 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008538`
GeneID	`131008538`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008538`
原始查询	`SmilChr01G002607`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G43760` (AT1G43760) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=28.4; qcov=0.38; evalue=8.78e-36; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=26.6; qcov=0.588; evalue=9.91e-70; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008538

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057791433.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057791433.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057791433.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791433.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791433.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:44256691`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B126,B25,B71,B72
`Chr1:44256714`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B98,C48
`Chr1:44256760`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr1:44256909`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:44256910`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,B94
`Chr1:44256943`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A11,A2,B19,B25,B60,B62,B99,C3,C53,C84
`Chr1:44256952`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B6,B60,C3
`Chr1:44256971`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	15	A11,A2,B19,B6,B60,B62,B83,B93,B99,C3,C53,C74,C84,C87,D8
`Chr1:44256977`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B126
`Chr1:44256992`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B104,B82,B99,C53,C87
`Chr1:44256992`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B104,B82,B99,C53,C87
`Chr1:44256995`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B104,B82,B99,C53,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791433.1

1074 aa

537

1074

RVT_1

PF00078 RVT_1 635-826 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791433.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	635	826	1.2e-24	88.1	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935450.1
ATGATAGCTCTCTATATGTGGAATTCAGTTATGAAAATCTACCTGCCTTTTGTACTCGTTGTAAGATCACAGGGCATTCTATCGAGAAATGTCGAAGAACGAAAGCGGAGGACGGCAGCGGCTGCATGGCAACCTAAAGAAGTGGTGAATGATACACAATCGGGAGACAACGTAGATGGCCTGATTGAAGACCTGGACGTTGGGAAAACGGATGGCACAACTGAGAAATATCCTGAGTCTTTACAGGAGGACCGGAGTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008538
ATGATAGCTCTCTATATGTGGAATTCAGTTATGAAAATCTACCTGCCTTTTGTACTCGTTGTAAGATCACAGGGCATTCTATCGAGAAATGTCGAAGAACGAAAGCGGAGGACGGCAGCGGCTGCATGGCAACCTAAAGAAGTGGTGAATGATACACAATCGGGAGACAACGTAGATGGCCTGATTGAAGACCTGGACGTTGGGAAAACGGATGGCACAACTGAGAAATATCCTGAGTCTTTACAGGAGGACCGGAGTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791433.1
MIALYMWNSVMKIYLPFVLVVRSQGILSRNVEERKRRTAAAAWQPKEVVNDTQSGDNVDGLIEDLDVGKTDGTTEKYPESLQEDRSGNSGPDMLERILVAAKDSEVIPTTDHMDNEISHLNSSSGALIADDPATEMTEGEPSSFLKGGTLQETDLKALALENAVKIQRLESFFKEIPQGNAAKRGRGRPPGSGRGGRTLHTPATDSIKNRLRKSIDLGHKNLRFRVAIIHGANDAVLRRKLWAGLLNFTDGNTVFIGDFN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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