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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002627`

染色体: Chr01 坐标: 44552414-44559077 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002627`
名称	SmilChr01G002627
描述	phytyl ester synthase 1, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	44552414 - 44559077 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985231`
GeneID	`130985231`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985231`
原始查询	`SmilChr01G002627`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phytyl ester synthase 1, chloroplastic-like
产物	phytyl ester synthase 1%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT1G54570` (PES1) Esterase/lipase/thioesterase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841899] identity=58.4; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0362100` - identity=56.2; qcov=0.966; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0008374 (GO:0008374); GO:0016020 (membrane)
KEGG	smil00073 (Cutin, suberine and wax biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00561 (Glycerolipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00561 (Abhydrolase_1); PF03982 (DAGAT); PF12146 (Hydrolase_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985231

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057764058.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.80000	`XP_057764058.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057764058.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764058.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764058.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:44552912`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr1:44553039`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B3,B46
`Chr1:44554184`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C31
`Chr1:44556377`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr1:44556786`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr1:44557298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr1:44557583`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr1:44558459`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B134,B86
`Chr1:44558501`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,C28
`Chr1:44558575`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764058.1

712 aa

356

712

Hydrolase_4

Abhydrolase_1

DAGAT

PF12146 Hydrolase_4 193-379 aa PF00561 Abhydrolase_1 194-379 aa PF03982 DAGAT 506-583 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764058.1`	Pfam	`PF12146`	Hydrolase_4	Domain	193	379	3.8e-10	40.2	Serine aminopeptidase, S33
`XP_057764058.1`	Pfam	`PF00561`	Abhydrolase_1	Domain	194	379	1.1e-06	29.2	alpha/beta hydrolase fold
`XP_057764058.1`	Pfam	`PF03982`	DAGAT	Family	506	583	4.1e-05	23.4	Diacylglycerol acyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908075.1
GGAATAATATGTGGAGATGGTGCCATTATGATTCTCAAAGCGTCCCCCTGATTCCATTTCTGGCTTAAACGCTTGCAAACTTTCCGAGTTGCTTTTGTCGTTTTTTGTTCTTCAATGGAAGTAATCGCGACTGGCCATGTGAATTCTCATTCTAGTGTTGGTTTCTTGGTTGTTTATAGTGACACGAAACTCACACACCCGCAGACTAAATTTTGTGTGGCCTCTATTTCTTTCTTGTCTCTTCTCATTTTCTCTTTTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985231
ATGGCTTCAACTGTGAAGAGTTTTTCTCTATCACCACCTCATTTTGCTTCGAATTTAGAGAGAAGGGCTCATTCTAGATACTCAGTCAGGTGTTTATCTAGTAAGGATTCCACTGCTGCATTATCTTTTGATTCTGTGAAAGTTAATGGTGCAGCGAGTGGAGTGTCCTCTGCTGTGAAGGAGGAGAGAGAGAAGGTTGATCATGTGAGCTCAGTTGTTGAGGGAAAGAGGAGAGAGAAGGAGTCTCAGGAGGTAAAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764058.1
MASTVKSFSLSPPHFASNLERRAHSRYSVRCLSSKDSTAALSFDSVKVNGAASGVSSAVKEEREKVDHVSSVVEGKRREKESQEVKLEALWDDGYGTETVRDYLDYAGDIIKPDGGPVRWFTPISCGPHLRGSPVLFFLSGLDGLGLGLILHHKSLGKVFDVRCMHIPVQDRTPFEELVVWVEGSLRAEHSSCPNKPIYLVGDSFGGCLALAVAARNPDIDLVVILANPATSFGRSQLQPFLPLLEALPNELHNAVPYLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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