当前解析结果
SmilChr01G002639| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002639 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002639 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G002639 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 44675989 - 44676734 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130985386 |
|---|---|
| GeneID | 130985386 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130985386 |
| 原始查询 | SmilChr01G002639 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | selenium binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829263]; symbol=AT4G31360; hit=AT4G31360; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | selenium binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829263]; symbol=AT4G31360; hit=AT4G31360; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT4G31360 (AT4G31360)selenium binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829263] identity=65.5; qcov=0.56; evalue=1.56e-37; confidence=medium |
| Rice | Os11g0704000- identity=58.6; qcov=0.74; evalue=3.24e-37; confidence=medium |
| GO | GO:0005794 (Golgi apparatus) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130985386 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057764331.1 |
| 2 | Nucleolus | 核仁 | 0.60000 | XP_057764331.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057764331.1 |
| 4 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057764331.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057764331.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:44676348 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C51 |
Chr1:44676471 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B26 |
Chr1:44676592 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 29 | A1,B103,B113,B118,B124,B128,B31,B36,B44,B46,B50,B51,B55,B59,B86,B9,B97,C17,C23,C29,C41,C44,C49,C52,C7,C75,C78,C79,C87 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。