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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002643`

染色体: Chr01 坐标: 44700653-44702525 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002643`
名称	SmilChr01G002643
描述	LIM domain-containing protein WLIM2b-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	44700653 - 44702525 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985431`
GeneID	`130985431`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985431`
原始查询	`SmilChr01G002643`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	LIM domain-containing protein WLIM2b-like
产物	LIM domain-containing protein WLIM2b-like
Arabidopsis	`AT2G39900` (WLIM2a) GATA type zinc finger transcription factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818577] identity=63.7; qcov=0.854; evalue=1.3e-80; confidence=high
Rice	`Os04g0532500` (PLIM2B) - identity=62.1; qcov=0.854; evalue=6.7e-80; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0015629 (actin cytoskeleton); GO:0051015 (actin filament binding); GO:0051017 (actin filament bundle assembly)
KEGG	-
Pfam	PF00412 (LIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985431

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	1.00000	`XP_057764399.1`
2	Cell projection	细胞突起	1.00000	`XP_057764399.1`
3	Pseudopodium	Pseudopodium	0.60000	`XP_057764399.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057764399.1`
5	Focal adhesion	Focal adhesion	0.20000	`XP_057764399.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:44701874`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:44702185`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B140
`Chr1:44702323`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764399.1

213 aa

106

213

LIM

PF00412 LIM 12-68 aa PF00412 LIM 108-164 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764399.1`	Pfam	`PF00412`	LIM	Domain	12	68	2.5e-24	86.0	LIM domain
`XP_057764399.1`	Pfam	`PF00412`	LIM	Domain	108	164	2.5e-24	86.0	LIM domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908416.1
AGTTTTGTAAAAGACCAATTAATTCATGTAGAGAAATTATTTGATCGAAGAAGAAAGAAGAATAAAAATAAGAGAAGGTGGAAAAAATGTCGTCGTCTTACTATGGCACGACGCAGAAATGCCACACTTGTGAAAAAGTGGTGCATTTTGCAGAAATGGTTTCCGCTGATGGAATTCCTTATCACAAGAATTGTTTCAAATGCGACCATTGCAACGGCCGTCTTGCTATAAGCAACTACTCTACCGTGGATGGGAAGCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985431
ATGTCGTCGTCTTACTATGGCACGACGCAGAAATGCCACACTTGTGAAAAAGTGGTGCATTTTGCAGAAATGGTTTCCGCTGATGGAATTCCTTATCACAAGAATTGTTTCAAATGCGACCATTGCAACGGCCGTCTTGCTATAAGCAACTACTCTACCGTGGATGGGAAGCTCTACTGCAAGCCTCACTTTGAACAACTCTTCAGGGAAACGGGCAGCTTCACTACTAAGAAGTTCCAATCAAGCTTAAGTGGGAAATA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764399.1
MSSSYYGTTQKCHTCEKVVHFAEMVSADGIPYHKNCFKCDHCNGRLAISNYSTVDGKLYCKPHFEQLFRETGSFTTKKFQSSLSGKYAELSRTPSKVSTMFSGTLDKCAVCKKTVYPLEKVTVEGEFYHKQCFRCAHGGCNLTTSSYAALDGILYCKPHFAQLFKEKGSYSHLTKTTSLKKNALPADLDLGDPPADKQPDAPPPADEPAAEET

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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