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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002660`

染色体: Chr01 坐标: 44846835-44855087 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002660`
名称	SmilChr01G002660
描述	protein LIKE COV 1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	44846835 - 44855087 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985511`
GeneID	`130985511`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985511`
原始查询	`SmilChr01G002660`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein LIKE COV 1-like
产物	protein LIKE COV 1-like
Arabidopsis	`AT2G20120` (COV1) CONTINUOUS VASCULAR RING protein (DUF502) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816531] identity=77.6; qcov=0.996; evalue=9.42e-147; confidence=high
Rice	`Os05g0529000` (OsCOLE1) - identity=78.1; qcov=1.02; evalue=2.37e-146; confidence=high
GO	GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0010222 (stem vascular tissue pattern formation)
KEGG	-
Pfam	PF04367 (DUF502)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985511

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057764496.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057764496.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057764496.1`
4	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.20000	`XP_057764519.1`
5	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.20000	`XP_057764519.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:44849505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,B3
`Chr1:44851826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr1:44853870`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764496.1

270 aa

135

270

DUF502

PF04367 DUF502 112-212 aa

XP_057764519.1

269 aa

134

269

DUF502

PF04367 DUF502 112-212 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764496.1`	Pfam	`PF04367`	DUF502	Family	112	212	9.7e-27	93.7	Protein of unknown function (DUF502)
`XP_057764519.1`	Pfam	`PF04367`	DUF502	Family	112	212	9.4e-27	93.7	Protein of unknown function (DUF502)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

6 records

下载 cDNA FASTA

XR_009088991.1
CAGCTCATCAAATGGCCCAAATTCAATCGTCATCCATCGTTGAATTTTGTGATTTACAACTAAAACACCAATTTAAATTGGTTCTCATTATTATTGGTTGATGCCTAATCTAACCAGCCATAACCCATAACAGTAAAGGAATGCTCATTCAATTCAAGCTCAATTTCTAGAGAGAGGGGCGGCTGAACACTGAATCTGTTAAGACTGAGAGTCTTTAAGGAGTGTGTGTGATGGGAGATGAGAAATCTCTCGGCGTGATG...

XR_009088992.1
CAGCTCATCAAATGGCCCAAATTCAATCGTCATCCATCGTTGAATTTTGTGATTTACAACTAAAACACCAATTTAAATTGGTTCTCATTATTATTGGTTGATGCCTAATCTAACCAGCCATAACCCATAACAGTAAAGGAATGCTCATTCAATTCAAGCTCAATTTCTAGAGAGAGGGGCGGCTGAACACTGAATCTGTTAAGACTGAGAGTCTTTAAGGAGTGTGTGTGATGGGAGATGAGAAATCTCTCGGCGTGATG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130985511
ATGGGAGATGAGAAATCTCTCGGCGTGATGGGCAGCGGCAGAGACAGAGATCGCGAGCTTCTTATACCGGTGGCTGATTCTGTTGACCGCCGCCTCGATGACGACGGCCCCTCCTCCGCCTCCGCTTCCTCCTCCCACCATCATTCTGGCCGTGAGACATTTTACAAAGTCGTGAGGAGCTGGGCTTCGAAGAAGTTCATGACTGGATGTGTCATCCTTCTACCAATAGCTATTACTTTCTATGTAACATGGTGGTTCAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057764496.1
MGDEKSLGVMGSGRDRDRELLIPVADSVDRRLDDDGPSSASASSSHHHSGRETFYKVVRSWASKKFMTGCVILLPIAITFYVTWWFIHFVDGFFSPIYAQLGIDIFGLGFVTSITFIFLVGVFMSSWLGASVLSLGEWFIKRMPFIRHIYNASKQISAAISPDQNTRAFKEVAIIRHPRIGEYAFGFITSSLTLQSYSGEEELCCVYVPTNHLYIGDMFLVNAKDVIRPNLSVREGIGKICLHLFWYDNEVVAFFAFTDC...

XP_057764519.1
MGDEKSLGVMGSGRDRDRELLIPVADSVDRRLDDDGPSSASASSSHHHSGRETFYKVVRSWASKKFMTGCVILLPIAITFYVTWWFIHFVDGFFSPIYAQLGIDIFGLGFVTSITFIFLVGVFMSSWLGASVLSLGEWFIKRMPFIRHIYNASKQISAAISPDQNTRAFKEVAIIRHPRIGEYAFGFITSSLTLQSYSGEEELCCVYVPTNHLYIGDMFLVNAKDVIRPNLSVREGIEIVVSGGMSMPQILSTLDRHTTQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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