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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002662`

染色体: Chr01 坐标: 44868340-44870608 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002662`
名称	SmilChr01G002662
描述	rho guanine nucleotide exchange factor 8-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	44868340 - 44870608 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985553`
GeneID	`130985553`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985553`
原始查询	`SmilChr01G002662`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rho guanine nucleotide exchange factor 8-like
产物	rho guanine nucleotide exchange factor 8-like
Arabidopsis	`AT3G24620` (ROPGEF8) RHO guanyl-nucleotide exchange factor 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822058] identity=60.9; qcov=0.978; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0560100` (Os) - identity=56.6; qcov=0.998; evalue=1.64e-179; confidence=high
GO	GO:0005085 (guanyl-nucleotide exchange factor activity)
KEGG	-
Pfam	PF03759 (PRONE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985553

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057764566.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057764566.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764566.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764566.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057764566.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:44869375`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	A11,A24,C17,C22
`Chr1:44869375`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	4	A11,A24,C17,C22
`Chr1:44869382`	`A`	`AAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	A24
`Chr1:44869382`	`A`	`AAC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	A24
`Chr1:44869722`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr1:44869742`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,B19
`Chr1:44869772`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr1:44869787`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C3,C39
`Chr1:44870112`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr1:44870176`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764566.1

455 aa

228

455

PRONE

PF03759 PRONE 29-376 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764566.1`	Pfam	`PF03759`	PRONE	Family	29	376	3.1e-160	533.6	PRONE (Plant-specific Rop nucleotide exchanger)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908583.1
TTATTTTTTAGGAAAAATAGATTAAAGAAACGAGGTCCAACAATCATCTCTATTTTTGTCAACCAGAGAATATAGGGAAAAAACCTTTTTGGCAGTTGAATTCACCGCCTTAACAAAGAGGTTTTTCGGTGGTTTCATTCTCCCTCTTGCTGTAAACTCTTGCTACATTTCTCTCTCTCTCATTCCTCTTCCAAAAGATGCCTGATGATACGAATTCAGTCGATCAACACAACGGGAGTGGAGAAGAGATGCAAATCAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985553
ATGCCTGATGATACGAATTCAGTCGATCAACACAACGGGAGTGGAGAAGAGATGCAAATCAAGAATGAATCTGCAGCTGAGCCTTCAGATATGGATTTGATGAAGGAGAAATTTTCGAAGTTGCTTCTCGGGGAAGACATGTCGGGTGGTGGAAAGGGCGTTTCTTCTGCATTGGCCTTGTCCAATGCCATCACCAATCTTGCTGCTTCTGTTTTTGGGGAGCAGTCGAGGTTAGAGCCAATGTCTGCAACGAGGAAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764566.1
MPDDTNSVDQHNGSGEEMQIKNESAAEPSDMDLMKEKFSKLLLGEDMSGGGKGVSSALALSNAITNLAASVFGEQSRLEPMSATRKERWKKEIEWLVSITDYIVEFVPSQQKTKDGSNMEIMVTQQRRDLLLSIPALRKLDTMLLGILDNFEGEQEFKYVSRDADESQRGVQRSDKWWLPTVKVPPSGLSEESRRFLQKQQEAVNQVLKASMAINSQALSDMDIPESYIESLPKNGRESLGESLYRSITDEHFDPLQFLS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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