当前解析结果
SmilChr01G002663| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002663 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002663 |
| 描述 | probable protein ABIL1 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 44870500 - 44872319 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130985562 |
|---|---|
| GeneID | 130985562 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130985562 |
| 原始查询 | SmilChr01G002663 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | probable protein ABIL1 |
| 产物 | probable protein ABIL1 |
| Arabidopsis | AT5G42030 (ABIL4)ABL interactor-like protein 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834208] identity=34.1; qcov=0.531; evalue=1.15e-21; confidence=low |
| Rice | Os01g0760900- identity=43.2; qcov=0.465; evalue=6.07e-27; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF27594 (ABI) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130985562 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057764579.1 |
| 2 | Nucleus membrane | 核膜 | 0.20000 | XP_057764579.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057764579.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057764579.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057764579.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057764579.1PF27594
ABI 20-80 aa
XP_057764589.1PF27594
ABI 20-80 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057764579.1 |
Pfam | PF27594 |
ABI | Domain | 20 | 80 | 2e-13 | 50.8 | Abl interactor protein |
XP_057764589.1 |
Pfam | PF27594 |
ABI | Domain | 20 | 80 | 2e-13 | 50.9 | Abl interactor protein |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。