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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002664`

染色体: Chr01 坐标: 44872611-44876066 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002664`
名称	SmilChr01G002664
描述	proteinaceous RNase P 1, chloroplastic/mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	44872611 - 44876066 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985571`
GeneID	`130985571`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985571`
原始查询	`SmilChr01G002664`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	proteinaceous RNase P 1, chloroplastic/mitochondrial-like
产物	proteinaceous RNase P 1%2C chloroplastic/mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT2G32230` (PRORP1) proteinaceous RNase P 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817782] identity=56.9; qcov=0.546; evalue=2.98e-157; confidence=medium
Rice	`Os02g0273800` (P0413A11.14-1) - identity=58; qcov=0.73; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0001682 (tRNA 5'-leader removal); GO:0004526 (ribonuclease P activity); GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF01535 (PPR); PF13812 (PPR_3); PF16953 (PRORP); PF17177 (PPR_long); PF23276 (TPR_24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985571

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057764600.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057764600.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764600.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:44873426`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr1:44874493`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr1:44874655`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B127
`Chr1:44874867`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr1:44875079`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr1:44875301`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr1:44875519`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr1:44875647`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B127
`Chr1:44875670`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	A1,B118,B124,B55,B74,C17,C23,C28,C29,C41,C52,C87
`Chr1:44875868`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B69,C64,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764600.1

760 aa

380

760

PPR_long

PPR_3

PPR

TPR_24

PPR

PRORP

PF17177 PPR_long 127-188 aa PF17177 PPR_long 271-416 aa PF13812 PPR_3 282-333 aa PF01535 PPR 297-326 aa PF23276 TPR_24 299-400 aa PF01535 PPR 338-361 aa PF16953 PRORP 458-683 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764600.1`	Pfam	`PF17177`	PPR_long	Repeat	127	188	3e-69	233.3	Pentacotripeptide-repeat region of PRORP
`XP_057764600.1`	Pfam	`PF17177`	PPR_long	Repeat	271	416	3e-69	233.3	Pentacotripeptide-repeat region of PRORP
`XP_057764600.1`	Pfam	`PF13812`	PPR_3	Repeat	282	333	4e-08	33.9	Pentatricopeptide repeat domain
`XP_057764600.1`	Pfam	`PF01535`	PPR	Repeat	297	326	2.5e-08	34.3	PPR repeat
`XP_057764600.1`	Pfam	`PF23276`	TPR_24	Repeat	299	400	1.2e-08	35.7	Pentatricopeptide repeat-containing protein
`XP_057764600.1`	Pfam	`PF01535`	PPR	Repeat	338	361	2.5e-08	34.3	PPR repeat
`XP_057764600.1`	Pfam	`PF16953`	PRORP	Domain	458	683	9.6e-77	258.6	Protein-only RNase P

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009088999.1
ATCCAATACGATAAGATGAATCCATAAACATTAGTTGCGAGCTTTTCTCAAGGGCCACAAATGGCCTCCTTTTCTTCCACGTACAAACCTCTGCAACTCCACCTCTCTAATTTCTCTCTCAACACTTTCCCATTCCATCATTCTTCTCCTTCTCCTTCAAAACTCCCACTCATAACTCCACCTAACGTACGCCTCGCCGCTCGTCCCGAAACGGCGTTATCCCTTGATTCTGCTCGAGATGCTGATTTTCTTTCTGGCCT...

XM_057908617.1
ACACACCAAATTAAAAGTGTAAACTCACTCAGCGCCAAAATAACTGCCCAAGATGTACAACTGCAGAAGTGAATTTAGAAAAACATTAGTATGTTGGTATTTTTCACAGAATCCAATACGATAAGATGAATCCATAAACATTAGTTGCGAGCTTTTCTCAAGGGCCACAAATGGCCTCCTTTTCTTCCACGTACAAACCTCTGCAACTCCACCTCTCTAATTTCTCTCTCAACACTTTCCCATTCCATCATTCTTCTCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985571
ATGGCCTCCTTTTCTTCCACGTACAAACCTCTGCAACTCCACCTCTCTAATTTCTCTCTCAACACTTTCCCATTCCATCATTCTTCTCCTTCTCCTTCAAAACTCCCACTCATAACTCCACCTAACGTACGCCTCGCCGCTCGTCCCGAAACGGCGTTATCCCTTGATTCTGCTCGAGATGCTGATTTTCTTTCTGGCCTTTCTTCTTTCTCTGATACAACCAAAAGGGCTGATACTGGAAAAAAACCTGCTGAGCGAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764600.1
MASFSSTYKPLQLHLSNFSLNTFPFHHSSPSPSKLPLITPPNVRLAARPETALSLDSARDADFLSGLSSFSDTTKRADTGKKPAERRVILKDRYSNSKRRKDGNLRGPKEGGVRNGDNVEQKEKRIKKSKADQPGNMLRIGLDSCSKMGDVVAAIKLYDLARKEGIPIGQYHYAVLLYLCSSAAAGVVQPAKSGTRGRSLSSGDRESSQSLSDIVEMVNCRGGFSDEDLSSCVDGSRDVSGLSLDSLVQSMRKAAENSNS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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