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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002672`

染色体: Chr01 坐标: 44932958-44937001 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002672`
名称	SmilChr01G002672
描述	cyclin-dependent kinase F-1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	44932958 - 44937001 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985667`
GeneID	`130985667`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985667`
原始查询	`SmilChr01G002672`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cyclin-dependent kinase F-1
产物	cyclin-dependent kinase F-1
Arabidopsis	`AT4G28980` (CAK1AT) CDK-activating kinase 1AT [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829019] identity=58.2; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0334400` (CDKF) - identity=54; qcov=1.02; evalue=7e-159; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0019912 (GO:0019912)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985667

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057764730.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057764730.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057764730.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764730.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764730.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:44933518`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:44933614`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr1:44933884`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B110
`Chr1:44933884`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B110
`Chr1:44934056`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B9,C14,C15
`Chr1:44934169`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr1:44936448`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A18
`Chr1:44936448`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A18
`Chr1:44936558`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr1:44936738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr1:44936747`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,C18,C39,C9,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764730.1

469 aa

234

469

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF00069 Pkinase 21-167 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 23-166 aa PF00069 Pkinase 276-408 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764730.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	21	167	2.8e-54	185.0	Protein kinase domain
`XP_057764730.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	23	166	9.7e-20	71.7	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057764730.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	276	408	2.8e-54	185.0	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908747.1
TGATCGATTTTTTTGAGCTTATTATGTTGTTTGATAAATTTACCCGCAATTATTCGATCCAAAATGTTAGAATAATTAAATTCGAAAGAGAAGAAGCACGTGCGGAGAAGGCAGAAGTCACGTGAGTCATCTTCTACTTCCGTAACGCTCGAAAGCGAGTGGCCGACAATGGAGCAGCCGCCGTCGAAGAGCTGGAGCATCCACACGCGCCGCGAGATCACCGCCAAGTACGAGATCCTTGAGCGCGTGGGCTCCGGCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985667
ATGGAGCAGCCGCCGTCGAAGAGCTGGAGCATCCACACGCGCCGCGAGATCACCGCCAAGTACGAGATCCTTGAGCGCGTGGGCTCCGGCGCCTACTCCGACGTCTACAAGGCCCGCCGCCGCTCCGACTCCACCACCGTCGCCCTGAAGGAGGTGCACGACTACCAGTCCGCCTTCCGTGAGATCGAGGCCCTCCAGACGCTCCACAACTGCCCCAATGTTGTCCTCCTCCACGAGTACTTCTGGAGCGACGACGAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764730.1
MEQPPSKSWSIHTRREITAKYEILERVGSGAYSDVYKARRRSDSTTVALKEVHDYQSAFREIEALQTLHNCPNVVLLHEYFWSDDEDAVLVLEYLPTDLSAVVKAAKKDWDGGITVGELKRWMVQILRGVDACHRNSIVHRDLKPSNLLISADGILKIADFGQARILLAPGFLDEGAYDQLAEQPSSNQAAFPQPAEILPRLDGHVIQEHVEKSSEKGAAEPEDLRMGEFPNDGDEESVTHDGAASCLATCTTSDLEDPF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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