当前解析结果
SmilChr01G002687| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002687 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002687 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G002687 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 45087035 - 45090326 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130985801 |
|---|---|
| GeneID | 130985801 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130985801 |
| 原始查询 | SmilChr01G002687 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130985801 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057764910.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057764910.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057764910.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057764910.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057764910.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:45089368 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C63 |
Chr1:45089418 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B6,C25 |
Chr1:45089423 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B104,B109,B123,C21,C83 |
Chr1:45089445 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B53 |
Chr1:45089631 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 7 | B104,B22,B48,B7,B74,C85,C87 |
Chr1:45089904 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 88 | A11,A13,A16,A18,A22,A3,A4,A5,A9,B1,B100,B102,B103,B106,B107,B11,B113,B117,B118,B12,B120,B127,B134,B136,B138,B2,B20,B23,B25,B26,B3,B31,B37,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B49,B59,B6,B60,B61,B62,B64,B65,B7,B71,B75,B8,B81,B82,B83,B84,B90,B98,C13,C14,C21,C24,C25,C26,C27,C30,C33,C34,C37,C44,C47,C5,C51,C54,C58,C60,C62,C63,C67,C7,C71,C72,C73,C78,C80,C83,D10,D5,D6 |
Chr1:45089909 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B21,B4,C22,C41,C52 |
Chr1:45089910 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A9,B103,B25,B31,C80 |
Chr1:45089958 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | A23,B117,B118 |
Chr1:45089958 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A23,B117,B118 |
Chr1:45089982 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C71 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
17 records
下载 cDNA FASTA7 records
下载 CDS FASTA7 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。