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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002691`

染色体: Chr01 坐标: 45146628-45150823 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002691`
名称	SmilChr01G002691
描述	probable glutamate carboxypeptidase LAMP1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	45146628 - 45150823 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985903`
GeneID	`130985903`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985903`
原始查询	`SmilChr01G002691`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable glutamate carboxypeptidase LAMP1
产物	probable glutamate carboxypeptidase LAMP1
Arabidopsis	`AT5G19740` (AT5G19740) Peptidase M28 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832094] identity=64.2; qcov=0.97; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0743300` - identity=58.6; qcov=0.996; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004180 (carboxypeptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02225 (PA); PF04253 (TFR_dimer); PF04389 (Peptidase_M28)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985903

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057765063.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057765063.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057765063.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765063.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765063.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:45147117`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B21,B87
`Chr1:45147171`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr1:45147205`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,B62
`Chr1:45147408`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr1:45147418`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr1:45147472`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr1:45147498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:45147585`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C48,C56,C80,D10
`Chr1:45147768`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	58	A15,A21,A24,A6,B106,B112,B114,B115,B125,B129,B131,B133,B136,B138,B139,B15,B17,B18,B31,B42,B43,B44,B47,B51,B53,B54,B58,B59,B60,B62,B68,B69,B71,B78,B90,B94,C13,C20,C22,C28,C30,C35,C37,C38,C41,C47,C49,C51,C53,C56,C6,C64,C66,C75,C77,C80,D11,D8
`Chr1:45147772`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	61	A15,A2,A21,A24,A6,B106,B112,B114,B115,B125,B129,B131,B133,B136,B138,B139,B15,B17,B18,B26,B31,B42,B43,B44,B47,B51,B53,B54,B58,B59,B60,B62,B68,B69,B71,B78,B90,B94,C13,C20,C22,C28,C30,C35,C37,C38,C41,C43,C47,C49,C51,C53,C56,C6,C64,C66,C75,C77,C80,D11,D8
`Chr1:45148458`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B110,B21,C52
`Chr1:45148458`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B110,B21,C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765063.1

697 aa

348

697

Peptidase_M28

TFR_dimer

PF02225 PA 143-223 aa PF04389 Peptidase_M28 320-506 aa PF04253 TFR_dimer 568-691 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765063.1`	Pfam	`PF02225`	PA	Domain	143	223	8.8e-10	39.3	PA domain
`XP_057765063.1`	Pfam	`PF04389`	Peptidase_M28	Domain	320	506	1.9e-22	80.7	Peptidase family M28
`XP_057765063.1`	Pfam	`PF04253`	TFR_dimer	Domain	568	691	2.9e-35	121.6	Transferrin receptor-like dimerisation domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909080.1
ATAAAATCTTCCTCCCTAAATTCTTAAACAAACATTAACTGTTACCAAGAACTCCAAATTTCCTGAAAATGCTCAATCAATCACTCTCTGCTTAAATTTTCGATATCTTAAAATATCATTTTATGGATTCCTGAAGTGGACGCACCAATCATGCTGAATCATAGAGCGACAAAAACCTCATCACTCCATCCTTTTACAATGGTGAAGAAGATGAACTAAATATGCAGCCATTAATGAAAATCTTCAACTCCACTTGACCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985903
ATGTTGAAAGCAGTAGGCTTCATCAGCGTAGCCACTTCAATTTATTTCCTATTTCTAACACTCCCGCAAAATTCCTTCTACCACTCTCTCTTCATATCCGAATCCTTCTCCAACAATGAATCCATCTCCCACCACCTCTATATGCTCACGCGCCGCCCCCACATCGCCGGCTCCGAAGCCAACGCGGAGGCCGCCGCCTACGTCCTCTCCACCCTCACCTCCTACGGCGTTCCCTCCCACATAGCGCCCTACTACACAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765063.1
MLKAVGFISVATSIYFLFLTLPQNSFYHSLFISESFSNNESISHHLYMLTRRPHIAGSEANAEAAAYVLSTLTSYGVPSHIAPYYTALTYPVSRSLTLTLPPPQPPLHFTLRQEIYDGDPYADVAGEVEPTFHGYAKSGSAAGPAVYVNYGRVEDYATLAGMGVNVSGAVVLARYGEIYRGDIVLNAQAAGAVGALIYTDRKDYGGEKWFPDDKWMPPSGVQVGSVYTGAGDPTTPGWPSTEECERISEEEVEESGEVPL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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