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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002699`

染色体: Chr01 坐标: 45261264-45263971 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002699`
名称	SmilChr01G002699
描述	uncharacterized SmilChr01G002699
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	45261264 - 45263971 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985961`
GeneID	`130985961`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985961`
原始查询	`SmilChr01G002699`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DUF1005 family protein (DUF1005) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829053]; symbol=AT4G29310; hit=AT4G29310; species=arabidopsis; confidence=high
产物	DUF1005 family protein (DUF1005) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829053]; symbol=AT4G29310; hit=AT4G29310; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G29310` (AT4G29310) DUF1005 family protein (DUF1005) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829053] identity=66.8; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0133500` - identity=47.5; qcov=1.12; evalue=2.43e-121; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF06219 (DUF1005)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985961

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057765184.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057765184.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057765184.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765184.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765184.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:45261612`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B32
`Chr1:45261745`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B139,B88,C35,C70
`Chr1:45261772`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr1:45261819`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr1:45261822`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B69,C64,C66
`Chr1:45261870`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C33
`Chr1:45261870`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C33
`Chr1:45261882`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B105,B75
`Chr1:45261899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr1:45261942`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,C14,C20,C71
`Chr1:45261954`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B83,C18,D10,D11
`Chr1:45261956`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B85,C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765184.1

415 aa

208

415

DUF1005

PF06219 DUF1005 1-406 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765184.1`	Pfam	`PF06219`	DUF1005	Family	1	406	1.1e-154	516.5	Protein of unknown function (DUF1005)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909201.1
CGGCGCCAATTATGGAGTCCCACACAAAACATTTGTTTCTTGATGAAGTAATACTATTCCAAATAATATTCTGTTAAACATAAAACACAAGTTGAGTTTCTCCGTATCGTGGCGAGATATCGAAGATGAGCAATTGAGCAGTAGTAGTTCACAAAAAAATTCCTTCTCAAGCCTATAACTAATCCACTTTCACAAATCAATTTTCAGACACACACATAAAAAGAAAACACACACACACACCTGCATCATAAATTTCTCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985961
ATGGATCCATGCCCGTTCGTCCGTTTAAACGTGGAGTCATTAGCCCTGAAACTCGCCGCCGCCACCCGGCCGTCGGGGTCCGGCATCCACCCCTCCGCCACCCCATGCTACGCCAAGCTCAAGATCAAGAACTTCCCCTCGCAGACCGCCCTCCTCCCGCTCATCAGCGGCGCCGCCGCCAGCCCGCCGGATTCCTCCTCCGCCGCCACGTGCTTCGACCTTGACCCCGACGCCCTCCGTGCCCTCTCATGCAGGCCCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765184.1
MDPCPFVRLNVESLALKLAAATRPSGSGIHPSATPCYAKLKIKNFPSQTALLPLISGAAASPPDSSSAATCFDLDPDALRALSCRPVVALKIKVFSGRMGRTCGVTSGKLLGSLQLTVNLAHAQTRACVYHNGWMKLGGGGDPAARLHVTVRSEPDPRFVFQFGGEPECSPVVFQIQGNIRQPVFSCKFTADRSNRSRSLPTDFKTNSKRGWMRRTLSGEKDRVGRERKGWMIIVYDLSGSAVAAASMITPFVPSAGSDR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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