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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002711`

染色体: Chr01 坐标: 45358651-45362379 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002711`
名称	SmilChr01G002711
描述	SUMO-conjugating enzyme UBC9-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	45358651 - 45362379 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008736`
GeneID	`131008736`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008736`
原始查询	`SmilChr01G002711`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SUMO-conjugating enzyme UBC9-like
产物	SUMO-conjugating enzyme UBC9-like
Arabidopsis	`AT5G41700` (UBC8) ubiquitin conjugating enzyme 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834173] identity=70.6; qcov=1; evalue=3.36e-50; confidence=medium
Rice	`Os02g0261100` (UBC5B) - identity=69.6; qcov=1; evalue=1.82e-49; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00179 (UQ_con)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008736

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057791754.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057791754.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057791754.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791754.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791754.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:45358676`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B75
`Chr1:45358679`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,C14
`Chr1:45358686`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B108,B112,B15,B68,C23
`Chr1:45358686`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B112,B15,B68,C23
`Chr1:45358748`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:45358752`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	74	A11,A15,A20,A22,A6,A7,A9,B10,B104,B115,B121,B124,B134,B136,B137,B14,B17,B18,B19,B20,B21,B23,B25,B27,B28,B3,B31,B32,B37,B4,B42,B43,B5,B51,B54,B57,B58,B6,B61,B69,B71,B78,B80,B87,B97,B99,C10,C12,C15,C17,C18,C19,C20,C25,C28,C30,C40,C47,C49,C51,C53,C54,C59,C71,C77,C78,C80,C81,C82,C85,C87,D4,D5,D9
`Chr1:45359207`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B79
`Chr1:45359215`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B28,C11,C69
`Chr1:45359248`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:45359256`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:45359269`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,B46
`Chr1:45362312`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C12,C51,C58,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791754.1

102 aa

102

UQ_con

PF00179 UQ_con 5-102 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791754.1`	Pfam	`PF00179`	UQ_con	Domain	5	102	1.8e-31	109.4	Ubiquitin-conjugating enzyme

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935771.1
ATGACTTTAAAACGTATTTCGAAGGAACTCGAGGATATGCAGAAGGATCCTCCTATTTCTTTCAATGCAAGACCTGTTGCTGAAGATAAGTTTCATTGGAAAGCAACGATCATGGGGCCCACAGACAATTCGTATTCTGGAGGCACATTCTTTATTACAATTCGCTTCCCTCCAGATTATCCTATAAAGCCAACCAAGGTTGCTTTTAAGACTATGCTTTTCCACCCTAATATCAGTAGCATTGGAAGCATCAACTTTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008736
ATGACTTTAAAACGTATTTCGAAGGAACTCGAGGATATGCAGAAGGATCCTCCTATTTCTTTCAATGCAAGACCTGTTGCTGAAGATAAGTTTCATTGGAAAGCAACGATCATGGGGCCCACAGACAATTCGTATTCTGGAGGCACATTCTTTATTACAATTCGCTTCCCTCCAGATTATCCTATAAAGCCAACCAAGGTTGCTTTTAAGACTATGCTTTTCCACCCTAATATCAGTAGCATTGGAAGCATCAACTTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791754.1
MTLKRISKELEDMQKDPPISFNARPVAEDKFHWKATIMGPTDNSYSGGTFFITIRFPPDYPIKPTKVAFKTMLFHPNISSIGSINFDILKEQWSPTLTISNV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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