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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002728`

染色体: Chr01 坐标: 45632721-45634169 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002728`
名称	SmilChr01G002728
描述	uncharacterized SmilChr01G002728
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	45632721 - 45634169 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008796`
GeneID	`131008796`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008796`
原始查询	`SmilChr01G002728`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=28.5; qcov=0.815; evalue=1.5e-33; confidence=low
Rice	`Os06g0704400` - identity=34.7; qcov=0.815; evalue=4.8e-55; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03108 (DBD_Tnp_Mut); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008796

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791824.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057791824.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791824.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791824.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791824.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:45632726`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B119,B80,C33
`Chr1:45632736`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B88,C4
`Chr1:45632737`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B104
`Chr1:45632737`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B104
`Chr1:45632743`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B6,B65,B83
`Chr1:45632796`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr1:45632820`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,D11
`Chr1:45632854`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C78,C8
`Chr1:45632916`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B88,C56,C87,C9,D7
`Chr1:45633035`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B7
`Chr1:45633044`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,C21,C56,C6,C62
`Chr1:45633073`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B2,B39,B98,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791824.1

400 aa

200

400

DBD_Tnp_Mut

MULE

PF03108 DBD_Tnp_Mut 70-121 aa PF10551 MULE 249-345 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791824.1`	Pfam	`PF03108`	DBD_Tnp_Mut	Family	70	121	4.8e-06	26.8	MuDR family transposase
`XP_057791824.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	249	345	1.9e-16	60.9	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935841.1
ATGGAGTGTTGGGGTGAGAGTAGTGACAAAGACTACCAACCTAGTGAAACTGATTTGTCAGAAGTTAGCCTTCGTGATTTAGACTACATTTCTGATGAAGAAAATGTTGAATTGAGGAAGAAATTAAAAACAGCAGATAATGTTTTCAATTTGATGAATGTGAATGATGGGTTTGAAGCCGAGATAGAGCACACACATGATGGTTTGCAGTGTAGAGAGGCTTTAACCACTTGGGCAATTGAGAATGGTAGATACATTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008796
ATGGAGTGTTGGGGTGAGAGTAGTGACAAAGACTACCAACCTAGTGAAACTGATTTGTCAGAAGTTAGCCTTCGTGATTTAGACTACATTTCTGATGAAGAAAATGTTGAATTGAGGAAGAAATTAAAAACAGCAGATAATGTTTTCAATTTGATGAATGTGAATGATGGGTTTGAAGCCGAGATAGAGCACACACATGATGGTTTGCAGTGTAGAGAGGCTTTAACCACTTGGGCAATTGAGAATGGTAGATACATTCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791824.1
MECWGESSDKDYQPSETDLSEVSLRDLDYISDEENVELRKKLKTADNVFNLMNVNDGFEAEIEHTHDGLQCREALTTWAIENGRYIRFRAVSKKKLLAKCTLPCPWQVFASSMQGNGSFMIKSYHGDHNCPKAMSNKLLSSQWIAKRYVNVYRVRYNLGVKDLGADILQRFKVRVPKDRLYKARRLAQELVRGSIEQHYGQLENYIVELRRVDGEGRYELLLQGDSVFKALYVGLSALRKGFKTSCRPVIGIDGCFLKTY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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