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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002730`

染色体: Chr01 坐标: 45658126-45662265 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002730`
名称	SmilChr01G002730
描述	protein NDL1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	45658126 - 45662265 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986233`
GeneID	`130986233`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986233`
原始查询	`SmilChr01G002730`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NDL1-like
产物	protein NDL1-like
Arabidopsis	`AT5G56750` (NDL1) N-MYC downregulated-like 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835777] identity=77.8; qcov=0.939; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0192600` (SF21) - identity=74.1; qcov=0.936; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03096 (Ndr); PF12697 (Abhydrolase_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986233

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057765561.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057765561.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765561.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765561.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765561.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:45659724`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B128,B15
`Chr1:45659724`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B128,B15
`Chr1:45660129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B131,B78
`Chr1:45660293`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B56
`Chr1:45660508`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B38,B39,B63,C57
`Chr1:45661329`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765561.1

351 aa

176

351

Ndr

PF03096 Ndr 22-305 aa

XP_057765570.1

350 aa

175

350

Ndr

Abhydrolase_6

PF03096 Ndr 22-304 aa PF12697 Abhydrolase_6 69-291 aa

XP_057765578.1

343 aa

172

343

Ndr

PF03096 Ndr 14-297 aa

XP_057765587.1

346 aa

173

346

Ndr

Abhydrolase_6

PF03096 Ndr 18-300 aa PF12697 Abhydrolase_6 65-287 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765561.1`	Pfam	`PF03096`	Ndr	Domain	22	305	1.4e-111	372.5	Ndr family
`XP_057765570.1`	Pfam	`PF03096`	Ndr	Domain	22	304	3e-112	374.7	Ndr family
`XP_057765570.1`	Pfam	`PF12697`	Abhydrolase_6	Domain	69	291	1.1e-05	26.9	Alpha/beta hydrolase family
`XP_057765578.1`	Pfam	`PF03096`	Ndr	Domain	14	297	1.3e-111	372.6	Ndr family
`XP_057765587.1`	Pfam	`PF03096`	Ndr	Domain	18	300	2.9e-112	374.7	Ndr family
`XP_057765587.1`	Pfam	`PF12697`	Abhydrolase_6	Domain	65	287	1e-05	27.0	Alpha/beta hydrolase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909587.1
GAAAGCGTCGGTGGGAAATCGGTTTACTGAAATAGAAATAGAAAAAGAAAAAACTGGAAGAATTGTTGACATACAAAATATACAAAATATATATACATACATATTTCGTATAAATTATGTGAGATAAAAGGGGGCGAAAGAATCGCTTCGTATATAAGTCATCAAAAGCTGAAGACCCCTCATTCGATATATGTATGTATAATCGGATATTTATGTTTATTTAGAGAGAGAAACTCAGAGTAACAAATCCAATATTGTGT...

XM_057909578.1
AAAATATACAAAATATATATACATACATATTTCGTATAAATTATGTGAGATAAAAGGGGGCGAAAGAATCGCTTCGTATATAAGTCATCAAAAGCTGAAGACCCCTCATTCGATATATGTATGTATAATCGGATATTTATGTTTATTTAGAGAGAGAAACTCAGAGTAACAAATCCAATATTGTGTGCGTGTGTGAGGAAAGAGGCGACGGCATGGCTGAATTAAGCGTTGATTCCGTTTGCCTCGATGTGGAGACAATC...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC130986233
ATGGCTGAATTAAGCGTTGATTCCGTTTGCCTCGATGTGGAGACAATCTATCTCGGCGGGAAGGAGCATATTGTGCGAACAGGAAGTGGCTCAGTATCTGTTATTATTTACGGTGACCCAGACAAACCAGCTCTCATCACTTATCCAGATTTGGCTTTAAACCATGTATCTTGTTTTCAAGGTTTATTTTTTTGTCCGGAAGCAGCAGCATTGCTCCTTCACAATTTCTGCGTTTACCATATCAGCCCTCCTGGGCATGA...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057765561.1
MAELSVDSVCLDVETIYLGGKEHIVRTGSGSVSVIIYGDPDKPALITYPDLALNHVSCFQGLFFCPEAAALLLHNFCVYHISPPGHELGAAAISEGYPVPSVDDLADQILDVLNYFRLGAVMCMGVMAGAYILTLFAMKYRERVVGLILVSPLCKAPSWTEWLCNKVMSNLLYYYGMCGLLKECLLYRYFSKQEVRGNAEVPESDIVQACRRLLDERQGANVLRFLQAIDGRPDLTDGLRKLKCRTLIFVGDSSPFHSES...

XP_057765570.1
MAELSVDSVCLDVETIYLGGKEHIVRTGSGSVSVIIYGDPDKPALITYPDLALNHVSCFQGLFFCPEAAALLLHNFCVYHISPPGHELGAAAISEGYPVPSVDDLADQILDVLNYFRLGAVMCMGVMAGAYILTLFAMKYRERVVGLILVSPLCKAPSWTEWLCNKVMSNLLYYYGMCGLLKECLLYRYFSKEVRGNAEVPESDIVQACRRLLDERQGANVLRFLQAIDGRPDLTDGLRKLKCRTLIFVGDSSPFHSESL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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