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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002731`

染色体: Chr01 坐标: 45664202-45666868 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002731`
名称	SmilChr01G002731
描述	thiamine phosphate phosphatase-like protein
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	45664202 - 45666868 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986257`
GeneID	`130986257`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986257`
原始查询	`SmilChr01G002731`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	thiamine phosphate phosphatase-like protein
产物	thiamine phosphate phosphatase-like protein
Arabidopsis	`AT4G29530` (AT4G29530) Pyridoxal phosphate phosphatase-related protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829074] identity=50.3; qcov=0.819; evalue=5.84e-66; confidence=high
Rice	`Os02g0226200` - identity=44.5; qcov=0.878; evalue=2.15e-57; confidence=medium
GO	GO:0016791 (phosphatase activity)
KEGG	smil00750 (Vitamin B6 metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF06888 (Put_Phosphatase); PF12710 (HAD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986257

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057765596.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057765596.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765602.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765602.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057765602.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:45664810`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr1:45665052`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,C37
`Chr1:45666483`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765596.1

250 aa

125

250

Put_Phosphatase

HAD

PF06888 Put_Phosphatase 5-233 aa PF12710 HAD 7-182 aa

XP_057765602.1

238 aa

119

238

Put_Phosphatase

PF06888 Put_Phosphatase 32-221 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765596.1`	Pfam	`PF06888`	Put_Phosphatase	Family	5	233	3.4e-83	279.4	Putative Phosphatase
`XP_057765596.1`	Pfam	`PF12710`	HAD	Family	7	182	2.6e-08	35.2	haloacid dehalogenase-like hydrolase
`XP_057765602.1`	Pfam	`PF06888`	Put_Phosphatase	Family	32	221	2.6e-64	217.5	Putative Phosphatase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909613.1
TTACCACAAGAAGAACTAAGAGGCTGAAATGAAGAAGACAATCAATCGGCTCAGCTGCTGAAACGAGCTTAGAGAGAGAGAGAGAGAGGTCCGGCTGAAATGGCCGGGAAAATGGTGATTATATTTGATTTTGATAGAACGCTGATCGAAGACGACAGCGACAGATGGGTCTATACCAAGATGGGTCTCACCCAATTGTTCCGCGACCTGCGCCCCACATTACCTTGGAACTCTCTCATGGATAGGCTATTGGAGGAGCT...

XM_057909619.1
CTGATCGAAGACGACAGCGACAGATGGGTCTATACCAAGATGGGTCTCACCCAATTGTTCCGCGACCTGCGCCCCACATTACCTTGGAACTCTCTCATGGTCTCTATATTAATATACATACATATATTCCTATGCTATTGGAGGAGCTGCACATTAGAGGAAAATCGGTAGATGATATTGCTGATTGTTTGAGAGGGATGCCGTTGCATCCTAGGGTTGTTTCAGTGATTAAGTTAGCTCATGCTCTCGGATGTGACTTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986257
ATGGCCGGGAAAATGGTGATTATATTTGATTTTGATAGAACGCTGATCGAAGACGACAGCGACAGATGGGTCTATACCAAGATGGGTCTCACCCAATTGTTCCGCGACCTGCGCCCCACATTACCTTGGAACTCTCTCATGGATAGGCTATTGGAGGAGCTGCACATTAGAGGAAAATCGGTAGATGATATTGCTGATTGTTTGAGAGGGATGCCGTTGCATCCTAGGGTTGTTTCAGTGATTAAGTTAGCTCATGCTCT...

LOC130986257
ATGGGTCTATACCAAGATGGGTCTCACCCAATTGTTCCGCGACCTGCGCCCCACATTACCTTGGAACTCTCTCATGGTCTCTATATTAATATACATACATATATTCCTATGCTATTGGAGGAGCTGCACATTAGAGGAAAATCGGTAGATGATATTGCTGATTGTTTGAGAGGGATGCCGTTGCATCCTAGGGTTGTTTCAGTGATTAAGTTAGCTCATGCTCTCGGATGTGACTTGAAGGTGGCAAGCGACTCAAATCA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057765596.1
MAGKMVIIFDFDRTLIEDDSDRWVYTKMGLTQLFRDLRPTLPWNSLMDRLLEELHIRGKSVDDIADCLRGMPLHPRVVSVIKLAHALGCDLKVASDSNQFYIKTILEHYDIYSCFSEIITNPAVVDKGRLRIFPYHGSAAPHGCDLCPSNLCKGRVIEQTQVSLSESESRRLIYIGDGMNDFCPTLKLAAEDFVLPRKDFPLLSRILKNTHLVKAKVCEWNDSEDLARILGNLIECMSNEDKISSSTTQL

XP_057765602.1
MGLYQDGSHPIVPRPAPHITLELSHGLYINIHTYIPMLLEELHIRGKSVDDIADCLRGMPLHPRVVSVIKLAHALGCDLKVASDSNQFYIKTILEHYDIYSCFSEIITNPAVVDKGRLRIFPYHGSAAPHGCDLCPSNLCKGRVIEQTQVSLSESESRRLIYIGDGMNDFCPTLKLAAEDFVLPRKDFPLLSRILKNTHLVKAKVCEWNDSEDLARILGNLIECMSNEDKISSSTTQL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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