当前解析结果
SmilChr01G002743| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002743 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002743 |
| 描述 | transcription factor MYBS3-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 45732464 - 45733904 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130986346 |
|---|---|
| GeneID | 130986346 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130986346 |
| 原始查询 | SmilChr01G002743 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | transcription factor MYBS3-like |
| 产物 | transcription factor MYBS3-like |
| Arabidopsis | AT5G56840 (AT5G56840)myb-like transcription factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835786] identity=61; qcov=0.773; evalue=2.96e-60; confidence=high |
| Rice | Os01g0603300 (P0681B11.9-1)- identity=49.8; qcov=0.86; evalue=6.78e-59; confidence=high |
| GO | GO:0003677 (DNA binding); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0009723 (response to ethylene); GO:0009733 (response to auxin); GO:0009739 (response to gibberellin) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00249 (Myb_DNA-binding) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130986346 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057765725.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057765725.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057765725.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057765725.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057765725.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057765725.1PF00249
Myb_DNA-binding 101-146 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057765725.1 |
Pfam | PF00249 |
Myb_DNA-binding | Domain | 101 | 146 | 1.2e-10 | 42.1 | Myb-like DNA-binding domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。