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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002762`

染色体: Chr01 坐标: 46027492-46030826 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002762`
名称	SmilChr01G002762
描述	cytokinin dehydrogenase 4-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	46027492 - 46030826 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986529`
GeneID	`130986529`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986529`
原始查询	`SmilChr01G002762`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytokinin dehydrogenase 4-like
产物	cytokinin dehydrogenase 4-like
Arabidopsis	`AT4G29740` (CKX4) cytokinin oxidase 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829096] identity=48.9; qcov=0.98; evalue=1.59e-157; confidence=high
Rice	`Os02g0220000` (OsCKX6) - identity=46.2; qcov=1.05; evalue=8.69e-154; confidence=high
GO	GO:0009690 (cytokinin metabolic process); GO:0019139 (cytokinin dehydrogenase activity); GO:0071949 (FAD binding)
KEGG	smil00908 (Zeatin biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01565 (FAD_binding_4); PF09265 (Cytokin-bind)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986529

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057765947.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057765947.1`
3	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057765947.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765947.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057765947.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:46027600`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr1:46027778`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B100,B28
`Chr1:46027818`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B100,B28
`Chr1:46027819`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	A5,B100,B28
`Chr1:46027819`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	3	A5,B100,B28
`Chr1:46027824`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	A5,B100,B28
`Chr1:46027824`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	A5,B100,B28
`Chr1:46027835`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B100,B28
`Chr1:46027853`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,B71,B73
`Chr1:46027911`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	B100,B24,B26,B28,B37,C25,C55,C57
`Chr1:46027918`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B100,B24,B28,B37,C57
`Chr1:46027918`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B100,B24,B28,B37,C57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765947.1

495 aa

248

495

FAD_binding_4

Cytokin-bind

PF01565 FAD_binding_4 54-194 aa PF09265 Cytokin-bind 226-492 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765947.1`	Pfam	`PF01565`	FAD_binding_4	Domain	54	194	2e-16	60.7	FAD binding domain
`XP_057765947.1`	Pfam	`PF09265`	Cytokin-bind	Domain	226	492	6.6e-90	302.1	Cytokinin dehydrogenase 1, FAD and cytokinin binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057909964.1
TACCCCAAAGCAGCTCTTTTCCACACTCATTCCACTCTATAAATACGTAAACGAATTAATGCAGCAAATAAAATAAAATACTAATATAGATTTAAATAAAAATGAGTTGTTCAATTTCAACCCTCTCCATATTATTATCAATCCTTATCATAATCCATTCAATCCGCTCCGCCGCGAACCCATCGGCGCCGAACATCAGAAATGACTCCGATTCCCTCCGTAAGGGCTCGAGCGACTACGGCAACATCGTCCACGAGATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986529
ATGAGTTGTTCAATTTCAACCCTCTCCATATTATTATCAATCCTTATCATAATCCATTCAATCCGCTCCGCCGCGAACCCATCGGCGCCGAACATCAGAAATGACTCCGATTCCCTCCGTAAGGGCTCGAGCGACTACGGCAACATCGTCCACGAGATCCCCACGGGAGTCCTCTACCCGTCGACGGAAAAGGACATTATCGACCTAATCCGCTCTCGGAGTCCGCTGACGGTGGCGGCGAGGGGCCGCGGGCACTCGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057765947.1
MSCSISTLSILLSILIIIHSIRSAANPSAPNIRNDSDSLRKGSSDYGNIVHEIPTGVLYPSTEKDIIDLIRSRSPLTVAARGRGHSVRGQAMAGGGVVVDMTALGGKGGRIQISKSSSGMYADVGGEQLWIDVLRAAVAEGVAPVSWTDYVYLSVGGTLSNAGISGQAFLHGPQIANVVELDVITGKGEFMSCSRTRNPELFYGVLGGLGQFGIITRARIILDKAPTRVKWAKLLYSNFTTFSRDQEYLISNNCSNYVEG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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