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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002767`

染色体: Chr01 坐标: 46068997-46071935 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002767`
名称	SmilChr01G002767
描述	rop guanine nucleotide exchange factor 7-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	46068997 - 46071935 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986560`
GeneID	`130986560`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986560`
原始查询	`SmilChr01G002767`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rop guanine nucleotide exchange factor 7-like
产物	rop guanine nucleotide exchange factor 7-like
Arabidopsis	`AT5G02010` (ROPGEF7) RHO guanyl-nucleotide exchange factor 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831858] identity=74.7; qcov=0.714; evalue=1.29e-30; confidence=medium
Rice	`Os01g0849100` (OsRacGEF1) - identity=70.9; qcov=0.752; evalue=2.31e-31; confidence=medium
GO	GO:0005085 (guanyl-nucleotide exchange factor activity)
KEGG	-
Pfam	PF03759 (PRONE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986560

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057765988.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057765988.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057765988.1`
4	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057765988.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057765988.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:46070415`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	188	A10,A15,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A8,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B105,B106,B108,B109,B11,B110,B112,B113,B114,B118,B119,B12,B120,B122,B123,B125,B127,B129,B13,B130,B131,B135,B137,B138,B14,B140,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B22,B23,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B35,B36,B37,B4,B40,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B50,B51,B54,B55,B56,B59,B6,B60,B62,B63,B64,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B73,B74,B76,B77,B79,B81,B82,B83,B86,B87,B89,B9,B90,B92,B93,B94,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C12,C13,C15,C16,C17,C19,C20,C21,C22,C23,C26,C27,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C38,C39,C4,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C50,C51,C52,C53,C54,C56,C57,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C69,C7,C70,C71,C73,C75,C76,C77,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D9
`Chr1:46070419`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	B1,B128,B24,B35,B38,B39,B44,B85,C67,C78,C80,C83
`Chr1:46070426`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	C24,C78,C85,D7
`Chr1:46070426`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	CDS_variant	4	C24,C78,C85,D7
`Chr1:46070453`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr1:46070459`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C24,C85
`Chr1:46070816`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B67,C20,C62
`Chr1:46070823`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	B117,B137,B37,B41,B59,B67,B69,B84,B91,C10,C15,C37,C38,C74
`Chr1:46070845`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	B2,B23,B27,B37,B63,B83,B94,C17,C4,C59,D9
`Chr1:46070850`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C24,C78
`Chr1:46070857`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	B27,B63,B83,C17,C4,C59,D9
`Chr1:46070863`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	B27,B63,B83,C17,C4,C59,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057765988.1

105 aa

105

PRONE

PF03759 PRONE 27-104 aa

XP_057765994.1

105 aa

105

PRONE

PF03759 PRONE 27-104 aa

XP_057766000.1

105 aa

105

PRONE

PF03759 PRONE 27-104 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057765988.1`	Pfam	`PF03759`	PRONE	Family	27	104	4.1e-34	118.7	PRONE (Plant-specific Rop nucleotide exchanger)
`XP_057765994.1`	Pfam	`PF03759`	PRONE	Family	27	104	4.1e-34	118.7	PRONE (Plant-specific Rop nucleotide exchanger)
`XP_057766000.1`	Pfam	`PF03759`	PRONE	Family	27	104	4.1e-34	118.7	PRONE (Plant-specific Rop nucleotide exchanger)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

8 records

下载 cDNA FASTA

XR_009089311.1
CTGGAGCAATTCTTTCTCTCAGAAATGGCGACGGTTCTGGGGCAGCCGATATGGGAGATCGTCAGCAAGAACAATTCGTTTCTAGGGAAGGAGTCGGGGAATGGAACCGCTAGTGTGAAATTCAGGAAGGAGCCTAACAATCTACACCTTGCACTCCTACAATCACTCTGGAGGGGATGTTGTCCTTCTGTATGCATCAAAATATCTTGATATATACCTGTTGTTGTAAATCTTTCTGGTTGTTATGATCTCAAAAGAGG...

XR_009089313.1
CTGGAGCAATTCTTTCTCTCAGAAATGGCGACGGTTCTGGGGCAGCCGATATGGGAGATCGTCAGCAAGAACAATTCGTTTCTAGGGAAGGAGTCGGGGAATGGAACCGCTAGTGTGAAATTCAGGAAGGAGCCTAACAATCTACACCTTGCACTCCTACAATCACTCTGGAGGGGATGTTGTCCTTCTGTATGCATCAAAATATCTTGATATATACCTGTTGTTGTAAATCTTTCTGGTTGTTATGATCTCAAAAGAGG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130986560
ATGATCTCAAAAGAGGAACCGAGGAATGAATATTTTGGTAAAGATATCTTGGAAAACCTTAAGAAGGACAGATACATAGATGTTAAAACTGAGACAGATAGACGTGAGGTGCTGGCTGGGAGGGCCGAGAGCCTTCTCATCTGCTTGAAACTGAGGTTCTCTGGCCTGCCTCAAACCACACTAGACATATGCAAGATCCAATGCAACAAGGATGTGGGAAAATCTATATTGGAGAGCTATTCAAGAGTTCTTGAGAGCCT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057765988.1
MISKEEPRNEYFGKDILENLKKDRYIDVKTETDRREVLAGRAESLLICLKLRFSGLPQTTLDICKIQCNKDVGKSILESYSRVLESLAFNIVARIDDLMSVDDLS

XP_057765994.1
MISKEEPRNEYFGKDILENLKKDRYIDVKTETDRREVLAGRAESLLICLKLRFSGLPQTTLDICKIQCNKDVGKSILESYSRVLESLAFNIVARIDDLMSVDDLS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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