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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002771`

染色体: Chr01 坐标: 46152617-46155559 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002771`
名称	SmilChr01G002771
描述	rhodanese-like domain-containing protein 6
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	46152617 - 46155559 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008863`
GeneID	`131008863`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008863`
原始查询	`SmilChr01G002771`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rhodanese-like domain-containing protein 6
产物	rhodanese-like domain-containing protein 6
Arabidopsis	`AT1G09280` (AT1G09280) rhodanese-like domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837449] identity=69.3; qcov=0.822; evalue=3.17e-112; confidence=high
Rice	`Os12g0563400` (OsStr18) - identity=70.8; qcov=0.779; evalue=3.32e-112; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12368 (Rhodanese_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008863

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057791946.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057791946.1`
3	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057791946.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057791946.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791946.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:46152639`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B64,C21
`Chr1:46152641`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr1:46153054`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B115,B71,B78
`Chr1:46153054`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B115,B71,B78
`Chr1:46153195`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B25
`Chr1:46153195`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B25
`Chr1:46153207`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,B27,C30
`Chr1:46153211`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C73,D3
`Chr1:46153211`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C73,D3
`Chr1:46153221`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C30
`Chr1:46153221`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C30
`Chr1:46153875`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,C31

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791946.1

281 aa

140

281

Rhodanese_C

PF12368 Rhodanese_C 166-231 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791946.1`	Pfam	`PF12368`	Rhodanese_C	Family	166	231	8.6e-15	55.5	Rhodanase C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935963.1
ATGAGTCATGAGCATGTTGTTGCAGCAGGTCCCACTATAGGGACTTCAAAGGCAAAAGAATTGGTGACGTTAAGCTCTCATCCCTTGTTGAAGTCTCCGGAGATTTCAAATGCTGGGAGACATCTCTCGGCAGCTGAATTTCACTCTGTTCTTCAGAATGCTGGTGAATGTCAAGAGTTAAGTAGTGGCTCCAACAAGGAACTGATACTGTTAGATGCAAGAAACTTGTACGAGACGAGAATAGGCAAGTTTCATGCTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008863
ATGAGTCATGAGCATGTTGTTGCAGCAGGTCCCACTATAGGGACTTCAAAGGCAAAAGAATTGGTGACGTTAAGCTCTCATCCCTTGTTGAAGTCTCCGGAGATTTCAAATGCTGGGAGACATCTCTCGGCAGCTGAATTTCACTCTGTTCTTCAGAATGCTGGTGAATGTCAAGAGTTAAGTAGTGGCTCCAACAAGGAACTGATACTGTTAGATGCAAGAAACTTGTACGAGACGAGAATAGGCAAGTTTCATGCTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791946.1
MSHEHVVAAGPTIGTSKAKELVTLSSHPLLKSPEISNAGRHLSAAEFHSVLQNAGECQELSSGSNKELILLDARNLYETRIGKFHAPDIKTLDPAIRQYSDLPSWIDDNSEQLRGNNILMYCTGGIRCEMASAYIRSKGAGFENVFQLYGGIQRYMEQFPDGGFFKGKNFVFDHRVSVGSLDPIVLGTCLLCGVSFDNYTSRCRCTHCRMLVLVCDHCREINRSYVCELCQKDGKPVKSICSMSGEVPETAYDNQSLEID...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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