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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002772`

染色体: Chr01 坐标: 46160839-46164424 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002772`
名称	SmilChr01G002772
描述	putative transcription factor bHLH041
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	46160839 - 46164424 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986629`
GeneID	`130986629`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986629`
原始查询	`SmilChr01G002772`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative transcription factor bHLH041
产物	putative transcription factor bHLH041
Arabidopsis	`AT5G56960` (AT5G56960) basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835798] identity=38.2; qcov=1.1; evalue=5.91e-85; confidence=medium
Rice	`Os06g0570900` (OsbHLH030) - identity=31.8; qcov=1.11; evalue=3.71e-35; confidence=low
GO	GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00010 (HLH); PF23132 (DUF7049); PF23133 (DUF7050); PF23177 (bHLH_IRO3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986629

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766074.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766074.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766074.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766074.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057766074.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:46161451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B131,B133,B60,B83
`Chr1:46161861`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B131,B133,B60,B83
`Chr1:46161932`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	A9,B115,B36,C12,C30,C49,C72
`Chr1:46162063`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A3,B139,B17,B20,B25,B92,C54,D3
`Chr1:46162066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	B42,B62,B68,C20,C28,C41,C52,C66,C72,C83
`Chr1:46162124`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,C54
`Chr1:46162155`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C41,C52,C72,C83
`Chr1:46162171`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C52,C72
`Chr1:46162200`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B22,C12,C72
`Chr1:46162223`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B22,C12,C72
`Chr1:46162232`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B22,C12
`Chr1:46162250`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B22,C12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766074.1

495 aa

248

495

DUF7050

HLH

bHLH_IRO3

DUF7049

PF23133 DUF7050 1-153 aa PF00010 HLH 314-360 aa PF23177 bHLH_IRO3 318-382 aa PF23132 DUF7049 399-492 aa

XP_057766083.1

490 aa

245

490

DUF7050

HLH

bHLH_IRO3

DUF7049

PF23133 DUF7050 1-148 aa PF00010 HLH 309-355 aa PF23177 bHLH_IRO3 313-377 aa PF23132 DUF7049 394-487 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766074.1`	Pfam	`PF23133`	DUF7050	Domain	1	153	2.1e-53	180.9	Domain of unknown function (DUF7050)
`XP_057766074.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	314	360	1.1e-11	45.1	Helix-loop-helix DNA-binding domain
`XP_057766074.1`	Pfam	`PF23177`	bHLH_IRO3	Domain	318	382	4.7e-10	40.4	Iron-related transcription factor 3 bHLH domain
`XP_057766074.1`	Pfam	`PF23132`	DUF7049	Domain	399	492	1.9e-20	73.8	Domain of unknown function (DUF7049)
`XP_057766083.1`	Pfam	`PF23133`	DUF7050	Domain	1	148	4.9e-48	163.4	Domain of unknown function (DUF7050)
`XP_057766083.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	309	355	1.1e-11	45.1	Helix-loop-helix DNA-binding domain
`XP_057766083.1`	Pfam	`PF23177`	bHLH_IRO3	Domain	313	377	4.6e-10	40.4	Iron-related transcription factor 3 bHLH domain
`XP_057766083.1`	Pfam	`PF23132`	DUF7049	Domain	394	487	1.9e-20	73.8	Domain of unknown function (DUF7049)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910091.1
TGGACAGCATTAAAACCATCCTCACCACACCACCAACCCCATCACATACTTTTCAAATCTTCCCTCCATTAATCCCACTCATCATCCATCACCTCTGGTCTACTAGTATGCATACTTGTACTTCTCTTTCCATGGATGAATGTATCTAGAATTCTGTCTTCCTAATTAAGCAGCTATGGACTCCATTTTTCACCTTGAGAATGGTGATCGCGCCGCCTTCCTCAAGCAAATGATGCAAGCTTTTGGGTGTGTCTACATCT...

XM_057910100.1
GGACAGCATTAAAACCATCCTCACCACACCACCAACCCCATCACATACTTTTCAAATCTTCCCTCCATTAATCCCACTCATCATCCATCACCTCTGGTCTACTAGTATGCATACTTGTACTTCTCTTTCCATGGATGAATGTATCTAGAATTCTGTCTTCCTAATTAAGCAGCTATGGACTCCATTTTTCACCTTGAGAATGGTGATCGCGCCGCCTTCCTCAAGCAAATGATGCAAGCTTTTGGGTGTGTCTACATCTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986629
ATGGACTCCATTTTTCACCTTGAGAATGGTGATCGCGCCGCCTTCCTCAAGCAAATGATGCAAGCTTTTGGGTGTGTCTACATCTGCCTCAGGTGTTATGTACCTCCACCATACAACTGTTTGAAGGGGTTGGATGGAATCTTCCATGAAACAAGCACATCGCATGGAAGCCTTGCTAGGCGCCTTTTTCATGTATATCGAGAATCATCCACCTATCCCGATTCCGGGCTAATCCCGGGGATTGCTTTCGCGAGCAGTAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057766074.1
MDSIFHLENGDRAAFLKQMMQAFGCVYICLRCYVPPPYNCLKGLDGIFHETSTSHGSLARRLFHVYRESSTYPDSGLIPGIAFASSNPYMKLQSHEFHGLVSSDFQLQFYQEAGIKTIVLMGCATGEIELGMSSDNPQVDVETEMKNLIRIHFPHHKDPNQPPSSSSSSLLSLSVDSPEYPPYLFNIPTTTTTAAAAFLPQQTLISSSSIPPHDQTIQILSQFRNAQFPSIESEDAAMTKAILAVLSSPSTSSTSQHKHI...

XP_057766083.1
MDSIFHLENGDRAAFLKQMMQAFGCVYICLRCYVPPPYNCLKGLDGIFHETSTSHGSLARRLFHVYRESSTYPDSGLIPGIAFASSNPYMKLQSHEFHGLVSSDFQLQFYQTIVLMGCATGEIELGMSSDNPQVDVETEMKNLIRIHFPHHKDPNQPPSSSSSSLLSLSVDSPEYPPYLFNIPTTTTTAAAAFLPQQTLISSSSIPPHDQTIQILSQFRNAQFPSIESEDAAMTKAILAVLSSPSTSSTSQHKHIPTAFR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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