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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002774`

染色体: Chr01 坐标: 46186229-46186729 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002774`
名称	SmilChr01G002774
描述	uncharacterized protein At4g02000-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	46186229 - 46186729 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008874`
GeneID	`131008874`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008874`
原始查询	`SmilChr01G002774`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0156200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0156200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G57587` (AT3G57587) Ta11-like non-LTR retrotransposon [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28719410] identity=28.1; qcov=0.88; evalue=3.44e-15; confidence=low
Rice	`Os12g0156200` - identity=33.8; qcov=0.873; evalue=2.08e-16; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF14392 (zf-CCHC_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008874

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057791957.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057791957.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791957.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791957.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791957.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:46186235`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr1:46186243`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr1:46186257`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B106,B17,B49,C30
`Chr1:46186257`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B17,B49,C30
`Chr1:46186264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B98,C3
`Chr1:46186270`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr1:46186301`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr1:46186303`	`G`	`GT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	1	C3
`Chr1:46186303`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C3
`Chr1:46186310`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C40
`Chr1:46186313`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C3
`Chr1:46186313`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791957.1

166 aa

166

zf-CCHC_4

PF14392 zf-CCHC_4 89-134 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791957.1`	Pfam	`PF14392`	zf-CCHC_4	Domain	89	134	5.4e-18	65.1	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935974.1
ATGCAACGTGTCTACGATGGTGGCCCTTGGTCGTTCGGAAACTTCCCTTTAATTCTTCACCGGCTCAAACATGGGGAGTTTCCTCTCACCGTGCCGTTGGATTCTCTACCGTTCTGGATCCAAATCCACGATCTCCCAGCAGGGTACCTCACGGAGGGTGTGGGGTGTCTCCTGGGGAATTTCATTGCGGATTTCATGGAGTACGATAGTTCCAACTCTTCTGGCGTTTGGCGCCAATACATACGCATAAGAGTTGTTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008874
ATGCAACGTGTCTACGATGGTGGCCCTTGGTCGTTCGGAAACTTCCCTTTAATTCTTCACCGGCTCAAACATGGGGAGTTTCCTCTCACCGTGCCGTTGGATTCTCTACCGTTCTGGATCCAAATCCACGATCTCCCAGCAGGGTACCTCACGGAGGGTGTGGGGTGTCTCCTGGGGAATTTCATTGCGGATTTCATGGAGTACGATAGTTCCAACTCTTCTGGCGTTTGGCGCCAATACATACGCATAAGAGTTGTTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791957.1
MQRVYDGGPWSFGNFPLILHRLKHGEFPLTVPLDSLPFWIQIHDLPAGYLTEGVGCLLGNFIADFMEYDSSNSSGVWRQYIRIRVVVRVSDPLKRFKKIKQKDGSSFTVNFKYERLNIFCFLCGRLGHFESYCELMFNPASKENEQEWGVWLKAADRRVVSLVAPI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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