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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002780`

染色体: Chr01 坐标: 46263174-46268254 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002780`
名称	SmilChr01G002780
描述	zinc finger CCCH domain-containing protein 65-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	46263174 - 46268254 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986783`
GeneID	`130986783`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986783`
原始查询	`SmilChr01G002780`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger CCCH domain-containing protein 65-like
产物	zinc finger CCCH domain-containing protein 65-like
Arabidopsis	`AT5G56930` (EMB1789) CCCH-type zinc finger family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835795] identity=40.9; qcov=0.34; evalue=1.17e-46; confidence=low
Rice	`Os01g0572100` (OsC3H7) - identity=37.1; qcov=0.177; evalue=4e-18; confidence=weak
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0045892 (negative regulation of DNA-templated transcription); GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986783

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766297.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766297.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766297.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766297.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057766297.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:46263933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B69,C64,C66
`Chr1:46264001`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C17
`Chr1:46264001`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C17
`Chr1:46264505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr1:46264525`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr1:46264546`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:46264745`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr1:46264818`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B17,B3,C41,C43
`Chr1:46264819`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:46264835`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C41,C43
`Chr1:46265074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B17,B3,C41,C43
`Chr1:46265080`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B17,B3,C41,C43

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910314.1
ATTGTCAATATAAATGATTTTTTTTTTCAAGTTCATTCTGTACGTTTAACATATTTAGTCGGATTAAACATTTTATTTTTGTAAAAATACATTTATTAACATTTTTCATGTCCTTTTTATAGCTTTTTTTAATCATATAAGAAAATTTTTGAAAAATCTCCTTTCTCCTAGTAGCAAATCTCCTCCTCCATTCCCAACCCCTAGCTTCCGCCATCGCTTCCCCGGCGCCGCTCAGCCGTCACCCACCGGCGGCACTGCTC...

XM_057910323.1
ATTGTCAATATAAATGATTTTTTTTTTCAAGTTCATTCTGTACGTTTAACATATTTAGTCGGATTAAACATTTTATTTTTGTAAAAATACATTTATTAACATTTTTCATGTCCTTTTTATAGCTTTTTTTAATCATATAAGAAAATTTTTGAAAAATCTCCTTTCTCCTAGTAGCAAATCTCCTCCTCCATTCCCAACCCCTAGCTTCCGCCATCGCTTCCCCGGCGCCGCTCAGCCGTCACCCACCGGCGGCACTGCTC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130986783
ATGGAGGACTCGCTGCCGCTGCACAGTTTAATCCTAAATCCCTCGGAAATCGCCTATAGTTTCCCTCCGCACCGCCGCCGGCCTCTCCCTAGCCGTACGTATGACGCGCTCATCCAAATTCTCTCTCTCCACCGTCCGCACCTCCAAATGCAAGAACCGGCGTGCGGAGAAGATGGATTTATCACTCATAGTCAGGTCATATCGACGGATATATTGGTTCCACATCCTAATAGCAAGGGGTCAGAGGATCAGGTAGTCCA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057766297.1
MEDSLPLHSLILNPSEIAYSFPPHRRRPLPSRTYDALIQILSLHRPHLQMQEPACGEDGFITHSQVISTDILVPHPNSKGSEDQVVQETPDGEGKENNVFQDCDSKHATTPKLHQPDLAGDSEKQLTPPNEIGIEDYMVVEEKADDCAAQNTKELENVNRVLDIEMDDFGTLKDVELENDSCFYQFSEVLDSCFGSDVAVESSESRQLSQEKGTVSKENLVKNMDYELQMKEMELEKLIYSSGNTEAPLCQNAGEIEEGE...

XP_057766306.1
MEDSLPLHSLILNPSEIAYSFPPHRRRPLPSRTYDALIQILSLHRPHLQMQEPACGEDGFITHSQVISTDILVPHPNSKGSEDQVVQETPDGEGKENNVFQDCDSKHATTPKLHQPDLAGDSEKQLTPPNEIGIEDYMVVEEKADDCAAQNTKELENVNRVLDIEMDDFGTLKDVELENDSCFYQFSEVLDSCFGSDVAVESSESRQLSQEKGTVSKENLVKNMDYELQMKEMELEKLIYSSGNTEAPLCQNAGEIEEGE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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