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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002787`

染色体: Chr01 坐标: 46343298-46347117 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002787`
名称	SmilChr01G002787
描述	cyclin-L1-1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	46343298 - 46347117 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986890`
GeneID	`130986890`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986890`
原始查询	`SmilChr01G002787`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cyclin-L1-1
产物	cyclin-L1-1
Arabidopsis	`AT2G26430` (RCY1) arginine-rich cyclin 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817183] identity=66.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0377500` (CycL1) - identity=61.8; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0016538 (cyclin-dependent protein serine/threonine kinase regulator activity)
KEGG	-
Pfam	PF00134 (Cyclin_N); PF21797 (CycT2-like_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986890

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766414.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057766414.1`
3	Nuclear speckle	核斑点	0.60000	`XP_057766414.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766414.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766414.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:46344868`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,B14,B15,C26
`Chr1:46345414`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,C61
`Chr1:46345478`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B32,B80,C5
`Chr1:46345918`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr1:46346343`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B113,B124,C12,C20
`Chr1:46346344`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr1:46346399`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,C37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766414.1

444 aa

222

444

Cyclin_N

CycT2-like_C

PF00134 Cyclin_N 11-147 aa PF21797 CycT2-like_C 153-225 aa

XP_057766422.1

440 aa

220

440

Cyclin_N

CycT2-like_C

PF00134 Cyclin_N 11-147 aa PF21797 CycT2-like_C 153-225 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766414.1`	Pfam	`PF00134`	Cyclin_N	Domain	11	147	2.4e-11	44.1	Cyclin, N-terminal domain
`XP_057766414.1`	Pfam	`PF21797`	CycT2-like_C	Domain	153	225	7.9e-09	35.9	Cyclin-T2-like, C-terminal domain
`XP_057766422.1`	Pfam	`PF00134`	Cyclin_N	Domain	11	147	2.4e-11	44.1	Cyclin, N-terminal domain
`XP_057766422.1`	Pfam	`PF21797`	CycT2-like_C	Domain	153	225	7.8e-09	35.9	Cyclin-T2-like, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910439.1
TCAAAAGACAAAACAAAAATAAATAAATAAACTCCTCCCTCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTAATTCCTTCTTCAGCACTACCGCCTCAGCCCCTTTTCTCCCAATTCATCAATAAAACTGGTGCTGTCATTGGATTTCAGAAACTGCAACGGCTTCCGGCTCTAGCTTCAGGTCAAGTATCATTGCGCTTGGTGAAAGATAGAACATGATTTATACGGCAATTGACACATTTTATCTGTCAGAAGAACAGCTGAAGAATTC...

XM_057910431.1
AAAATAAATAAATAAACTCCTCCCTCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTAATTCCTTCTTCAGCACTACCGCCTCAGCCCCTTTTCTCCCAATTCATCAATAAAACTGGTGCTGTCATTGGATTTCAGAAACTGCAACGGCTTCCGGCTCTAGCTTCAGGTCAAGTATCATTGCGCTTGGTGAAAGATAGAACATGATTTATACGGCAATTGACACATTTTATCTGTCAGAAGAACAGCTGAAGAATTCACCGTCTCGTAAAGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986890
ATGATTTATACGGCAATTGACACATTTTATCTGTCAGAAGAACAGCTGAAGAATTCACCGTCTCGTAAAGATGGTATCGACGAGGCCACTGAAACTACACTTAGAATCTACGGTTGCGACCTCATACAAGAGAGCGGCATATTGCTTAAGCTACCACAAGCTGTTATGGCGACTGGTCAAGTCCTATTTCATCGTTTCTACTGCAAGAAATCATTTGCTCGGTTTAATGTCAAGAGGGTTGCAGCTAGTTGTCTTTGGCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057766414.1
MIYTAIDTFYLSEEQLKNSPSRKDGIDEATETTLRIYGCDLIQESGILLKLPQAVMATGQVLFHRFYCKKSFARFNVKRVAASCLWLATKLEESPRKARQILIVFHRMECRRENLPIEHLDTSSKRYVDLKADLIRTERHLLKEMGFICHVEHPHKFISNYLATLEIPPELRQEAWNLANDSLRTTLCVRFKSEVVACGVVYAAARRSQVPLPENPPWWKAFDADKSGIDEVCRVLAHLYSLPKAQYIPVCKEGGSFATP...

XP_057766422.1
MIYTAIDTFYLSEEQLKNSPSRKDGIDEATETTLRIYGCDLIQESGILLKLPQAVMATGQVLFHRFYCKKSFARFNVKRVAASCLWLATKLEESPRKARQILIVFHRMECRRENLPIEHLDTSSKRYVDLKADLIRTERHLLKEMGFICHVEHPHKFISNYLATLEIPPELRQEAWNLANDSLRTTLCVRFKSEVVACGVVYAAARRSQVPLPENPPWWKAFDADKSGIDEVCRVLAHLYSLPKAQYIPVCKEGGSFATP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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