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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002793`

染色体: Chr01 坐标: 46437765-46442508 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002793`
名称	SmilChr01G002793
描述	telomere repeat-binding factor 4-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	46437765 - 46442508 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986922`
GeneID	`130986922`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986922`
原始查询	`SmilChr01G002793`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	telomere repeat-binding factor 4-like
产物	telomere repeat-binding factor 4-like
Arabidopsis	`AT1G72740` (AT1G72740) Homeodomain-like/winged-helix DNA-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843606] identity=47.2; qcov=1.01; evalue=3.29e-71; confidence=high
Rice	`Os01g0708000` (myb28) - identity=45.5; qcov=1.03; evalue=2.04e-62; confidence=high
GO	GO:0000786 (nucleosome); GO:0003691 (double-stranded telomeric DNA binding); GO:0006334 (nucleosome assembly)
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF00538 (Linker_histone); PF13921 (Myb_DNA-bind_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986922

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766474.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766474.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766474.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766474.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057766474.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:46438262`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,D6
`Chr1:46438436`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,C19,C41
`Chr1:46438906`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B15,C26
`Chr1:46439867`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766474.1

279 aa

140

279

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

Linker_histone

PF00249 Myb_DNA-binding 5-56 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 8-57 aa PF00538 Linker_histone 121-181 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766474.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	5	56	7.7e-09	36.2	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057766474.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	8	57	6.4e-07	30.2	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057766474.1`	Pfam	`PF00538`	Linker_histone	Domain	121	181	1.1e-09	39.0	linker histone H1 and H5 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910491.1
GAGGAAGCCCAGATTTTGGTGTAGCACACGCTGCACAGCGTTAGACGTCCAACTTAAGAAAAAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGCTTCCTTTCCTCGACTCGTCGCCGTTCTCATATTTGCAAAGAGGTTCCTGTTTGAGTTTTCTTTCGCTCCAATTCTGACAACGTAACAATCTGATTGTGTGGGAATCCGGAAATTGTTGGTTTGTTTGGCGGCGGAGATGGGGAATCCAAAGCAGAAGTGGACGGCGGAAGAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986922
ATGGGGAATCCAAAGCAGAAGTGGACGGCGGAAGAGGAAGAGGCGTTGCGGGCCGGCGTGGCCAAGCACGGCGCCGGAAAGTGGAAAAACATCCAGAGAGACCCCGAGTTCAACCACCTCCTCTTTGCTCGCTCCAATATTGATCTCAAGGATAAGTGGCGGAATTTGAGTGTTGCTAGTGGCCAAGGCCCAAGAGATAAATCAAAGACATCAAAAGGAAAATCCAATCCTGCTGACACTCCTTCTGCTCCACTGCCAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766474.1
MGNPKQKWTAEEEEALRAGVAKHGAGKWKNIQRDPEFNHLLFARSNIDLKDKWRNLSVASGQGPRDKSKTSKGKSNPADTPSAPLPIAQTSGSVAPSSKGASTDVVMLDSSRPLPEGISASKYNTMIFEALSTLKDLNGSDSSAIASFIEQRHEVPPNFRRALTSRLRTLVQQDKLEKVQNHYKIKNGAALDTRPPAPRQKDVQPRPIQSIGYLGDTVEEAAASAAYKIAEAENKSFVAAESVKEAERVARMAEDMESLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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