当前解析结果
SmilChr01G002794| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002794 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002794 |
| 描述 | glyoxylase I 4 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 46443274 - 46446295 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130986931 |
|---|---|
| GeneID | 130986931 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130986931 |
| 原始查询 | SmilChr01G002794 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | glyoxylase I 4 |
| 产物 | glyoxylase I 4 |
| Arabidopsis | AT5G57040 (AT5G57040)Lactoylglutathione lyase / glyoxalase I family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835808] identity=64.2; qcov=1.03; evalue=1.57e-88; confidence=high |
| Rice | Os07g0160400 (OsGLYI9)- identity=76.1; qcov=0.677; evalue=8.43e-77; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00903 (Glyoxalase) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130986931 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057766478.1 |
| 2 | Chloroplast stroma | 叶绿体基质 | 1.00000 | XP_057766478.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057766478.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057766478.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057766478.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:46443483 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A7,C21,C60,C81 |
Chr1:46443982 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B35 |
Chr1:46443994 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B112,B19,B44 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057766478.1PF00903
Glyoxalase 79-194 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057766478.1 |
Pfam | PF00903 |
Glyoxalase | Domain | 79 | 194 | 4.3e-11 | 44.0 | Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。