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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002803`

染色体: Chr01 坐标: 46570746-46573227 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002803`
名称	SmilChr01G002803
描述	uncharacterized SmilChr01G002803
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	46570746 - 46573227 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987049`
GeneID	`130987049`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987049`
原始查询	`SmilChr01G002803`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hydroxyproline-rich glycoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835811]; symbol=AT5G57070; hit=AT5G57070; species=arabidopsis; confidence=low
产物	hydroxyproline-rich glycoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835811]; symbol=AT5G57070; hit=AT5G57070; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G57070` (AT5G57070) hydroxyproline-rich glycoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835811] identity=42.2; qcov=0.323; evalue=6.26e-30; confidence=low
Rice	`Os01g0584100` - identity=68.8; qcov=0.052; evalue=5.91e-07; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05553 (DUF761)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987049

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057766591.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766591.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766591.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766591.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766591.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:46570979`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr1:46570988`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B30,B75
`Chr1:46571207`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B61,B65,C37
`Chr1:46571238`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C35,C70,D9
`Chr1:46571247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr1:46571283`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr1:46571344`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr1:46571398`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B22,B98
`Chr1:46571415`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B22
`Chr1:46571417`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B22
`Chr1:46571418`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:46571421`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766591.1

616 aa

308

616

DUF761

PF05553 DUF761 580-606 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766591.1`	Pfam	`PF05553`	DUF761	Family	580	606	1.4e-05	25.3	Cotton fibre expressed protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910608.1
TCCAAATAACAGTACTCTTATTCCATTATTGCGATGAATCCTTACCGTCAAAGATAAAAAAGAAAAATGAAACATTTTATTTCTAACTAAATTAAAATTCAAAACCTATTGGTATATAGAGTGTAGTATATGTCTGTCATGCATTGTTAATTCCCATTCACCAAAACAAGCTTTATATATAAACTCTCAAAAGCAAAGCAACCTCCCAACCACAGAACGAAGCTCATGGAACCCAACGGCGACTCCTTCTGGTTTCAACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987049
ATGGAACCCAACGGCGACTCCTTCTGGTTTCAACCCCCCGCCGTGCTCCACCCCCGCCGCCGCCGTCCTCAGCCGGCTCCGCTCGTCAATCCGGTGGCTCTAATCCTTACCATTCCAATTATCGCTCTGCTCATACTGTTTTTTGTGCTACCTCCATTTATCTCTCACACGAATCAAATCCTCAGACCCAATTCGGTTAAGAAGAGCTGGGATTCGCTCAACATCGTCTTGGTTTTGTTCGCCATTCTCTGCGGCGTCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766591.1
MEPNGDSFWFQPPAVLHPRRRRPQPAPLVNPVALILTIPIIALLILFFVLPPFISHTNQILRPNSVKKSWDSLNIVLVLFAILCGVFARRNDEAPPSEEAVAADDRRIPAAAATVSNFVDRPRQSVPAWMDFPDQRDYNSIGSGSSVGGGGLRRSSSSYPDLRQESVWESEGGNRNRFFDDFEVNFYRSPPREENYELRRRRSHEAERQEAEPVVREIHVDKFEISSAPSPPPPPPPPPKSATPPPPPPPPPTLKRRRSL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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