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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002808`

染色体: Chr01 坐标: 46620761-46622940 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002808`
名称	SmilChr01G002808
描述	ankyrin repeat-containing protein BDA1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	46620761 - 46622940 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987085`
GeneID	`130987085`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987085`
原始查询	`SmilChr01G002808`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ankyrin repeat-containing protein BDA1-like
产物	ankyrin repeat-containing protein BDA1-like
Arabidopsis	`AT4G10720` (AT4G10720) Ankyrin repeat family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826666] identity=32.8; qcov=0.88; evalue=7.06e-52; confidence=low
Rice	`Os02g0735700` - identity=29.7; qcov=0.848; evalue=2.43e-36; confidence=low
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0008157 (protein phosphatase 1 binding); GO:0019888 (protein phosphatase regulator activity); GO:0035304 (GO:0035304)
KEGG	-
Pfam	PF00023 (Ank); PF12796 (Ank_2); PF13606 (Ank_3); PF13637 (Ank_4); PF13962 (PGG)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987085

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057766674.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766674.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766674.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766674.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766674.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:46620969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C35,C70,D9
`Chr1:46620996`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C35,C70,D9
`Chr1:46621065`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr1:46621068`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C35,C70,D9
`Chr1:46621139`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B67
`Chr1:46621139`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B67
`Chr1:46621308`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,D7
`Chr1:46621332`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:46621357`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B46
`Chr1:46621357`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B46
`Chr1:46621361`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B46
`Chr1:46621361`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766674.1

468 aa

234

468

Ank_2

Ank

Ank_4

Ank_3

Ank

Ank_2

Ank

Ank_2

Ank_3

Ank

PGG

PF12796 Ank_2 22-96 aa PF00023 Ank 38-58 aa PF13637 Ank_4 41-88 aa PF13606 Ank_3 71-96 aa PF00023 Ank 71-97 aa PF12796 Ank_2 91-161 aa PF00023 Ank 104-126 aa PF12796 Ank_2 134-212 aa PF13606 Ank_3 183-212 aa PF00023 Ank 183-215 aa PF13962 PGG 282-401 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766674.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	22	96	5.9e-37	126.8	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057766674.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	38	58	1.8e-31	107.1	Ankyrin repeat
`XP_057766674.1`	Pfam	`PF13637`	Ank_4	Repeat	41	88	6.9e-21	74.6	Ankyrin repeats (many copies)
`XP_057766674.1`	Pfam	`PF13606`	Ank_3	Repeat	71	96	2.5e-25	86.2	Ankyrin repeat
`XP_057766674.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	71	97	1.8e-31	107.1	Ankyrin repeat
`XP_057766674.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	91	161	5.9e-37	126.8	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057766674.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	104	126	1.8e-31	107.1	Ankyrin repeat
`XP_057766674.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	134	212	5.9e-37	126.8	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057766674.1`	Pfam	`PF13606`	Ank_3	Repeat	183	212	2.5e-25	86.2	Ankyrin repeat
`XP_057766674.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	183	215	1.8e-31	107.1	Ankyrin repeat
`XP_057766674.1`	Pfam	`PF13962`	PGG	Domain	282	401	4.4e-28	98.1	Domain of unknown function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910691.1
TTCACGGCAAACGTGTTTCAAGAAAGGTTTATTGGCATATAGTTTTATACTCACATATTTTAGAATACAACAATAATTTAAAAGGGGAAAAAGTAAGAGTAAATTAAATATACATTCTTCCCGAGTTAAAAAAGAATTAAAAAGTATTGGTACAAGAATATTGAAAACTTGATATGCGAGTGGAATAGTAGAAACGACCTTTATTCGTCAACCTCTTCTGGAAGACCATTCATTTCTTCCACTCCTCGTCTTTCAACATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987085
ATGGAGAGGAGATTATCTGAAGCAGCTTTTCGAGGAGATCTGATCGACCTACACAAGATCGTGGAAGAGGATCCCTTGATTCTGGACAGGATCACAGCTTCCTGCGTCGACGAAACGCCGCTCCACGCAGCCGCCGTGCTCGGCCACCTCAGCTTTGTCAAGGAGCTGCTGAATCGGAAACCGGAGCTCGCGGCCGAGTCGGACTCGCGCGGATGCTCGCCGCTGCACCTGGCTGCGGCGAAGGGACACGCGGACGTCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766674.1
MERRLSEAAFRGDLIDLHKIVEEDPLILDRITASCVDETPLHAAAVLGHLSFVKELLNRKPELAAESDSRGCSPLHLAAAKGHADVVKELLLVNSDVASLRNLDGRTALHVAAVKGREGVLTELLGLAPGLTRVLTDRSETALHLCVKWNRYEAVKLLSEEMRKGSDESDADDSSLNWKDCIGNTALHIAVAEKHFEIIKFLLEQKEVEVNALNKNRLTALDLLRQSPRDKRDMEIEEALLSSGASSAKDLHLITDEQVE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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