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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002809`

染色体: Chr01 坐标: 46625784-46629099 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002809`
名称	SmilChr01G002809
描述	PHD finger protein ALFIN-LIKE 4-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	46625784 - 46629099 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987090`
GeneID	`130987090`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987090`
原始查询	`SmilChr01G002809`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PHD finger protein ALFIN-LIKE 4-like
产物	PHD finger protein ALFIN-LIKE 4-like
Arabidopsis	`AT5G20510` (AL5) alfin-like 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832173] identity=71.5; qcov=1.05; evalue=4.82e-122; confidence=high
Rice	`Os04g0444900` - identity=63.9; qcov=0.972; evalue=1.59e-110; confidence=high
GO	GO:0000976 (transcription cis-regulatory region binding); GO:0003712 (transcription coregulator activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0042393 (histone binding)
KEGG	-
Pfam	PF00628 (PHD); PF12165 (Alfin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987090

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766686.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057766686.1`
3	Nuclear body	核内小体	0.60000	`XP_057766686.1`
4	Nuclear speckle	核斑点	0.20000	`XP_057766686.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766686.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:46626790`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B30
`Chr1:46626790`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B30
`Chr1:46627685`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr1:46627710`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766686.1

248 aa

124

248

Alfin

PHD

PF12165 Alfin 11-138 aa PF00628 PHD 195-241 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766686.1`	Pfam	`PF12165`	Alfin	Family	11	138	2.3e-68	228.5	Alfin
`XP_057766686.1`	Pfam	`PF00628`	PHD	Domain	195	241	2e-09	38.1	PHD-finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910703.1
GAAGAGCATTTAGTAAAGGGATGAAAGTGCAATTTTCCAAAAATCTCCTGTCCAATTCCACCCTCATTTCTTGATATCCCAAAGTTGCCCCCAATAAATCCACAGAATACCGGTAATGCCCTTAACATTCCCCCTTCTTTGTCCTCCCTCTCCTGACTTGACTTTCCCAGTTTATTTTTGAAACCACTGCTGCAACAGAAACACACACACTGCAGCGTGTTTGTGCGTGAAAAATTGTACGGAGAAGCTATGGAGGTTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987090
ATGGAGGTTGGCGCCAACAACAGCCCTCGCACTGTGGAAGAGGTCTTCAGAGATTTCAAGGGCAGGCGTATTGGCTTGATCAAAGCTCTCACCACCGATGTTGAAGAATTTTTTCAACGGTGCGATCCTGAGAAGGAGAATCTATGCCTTTATGGATTTCCTACCGAGCAGTGGGAAGTTAATCTGCCTGCGGAGGAGGTGCCTCCAGAGCTACCGGAGCCCGCTTTAGGTATAAACTTTGCTAGAGATGGCATGCAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766686.1
MEVGANNSPRTVEEVFRDFKGRRIGLIKALTTDVEEFFQRCDPEKENLCLYGFPTEQWEVNLPAEEVPPELPEPALGINFARDGMQEKDWLALVAVHSDAWLLSVAFYFGARFGFDKADRKRLFNMINDLPTIFEVVTGASKMQFKDKVAVTTHSGSKSKPNLKMEKLSKPPSKDEGEGLDEEEEEEEEHGDTLCGACGENYAQDEFWICCDICERWFHGKCVKITPARAEHIKQYKCPSCSNKRARP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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