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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002822`

染色体: Chr01 坐标: 46765471-46765940 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002822`
名称	SmilChr01G002822
描述	uncharacterized SmilChr01G002822
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	46765471 - 46765940 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987251`
GeneID	`130987251`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987251`
原始查询	`SmilChr01G002822`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	photosystem II subunit X [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815210]; symbol=PSBX; hit=AT2G06520; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	photosystem II subunit X [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815210]; symbol=PSBX; hit=AT2G06520; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G06520` (PSBX) photosystem II subunit X [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815210] identity=59.5; qcov=1; evalue=2.22e-33; confidence=medium
Rice	`Os07g0673550` (P0470D12.144) - identity=73.5; qcov=0.562; evalue=1.1e-12; confidence=low
GO	GO:0009523 (photosystem II); GO:0015979 (photosynthesis); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF06596 (PsbX)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987251

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057766872.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057766872.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057766872.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766872.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766872.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:46765492`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B27
`Chr1:46765492`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B27
`Chr1:46765663`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B15,C26

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766872.1

121 aa

121

PsbX

PF06596 PsbX 84-120 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766872.1`	Pfam	`PF06596`	PsbX	Family	84	120	8.9e-16	58.4	Photosystem II reaction centre X protein (PsbX)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910889.1
ATGGCCTCAACTTCAGCAGTCTCAATGGCCCTGCCGCTGCCCCGTGCCGGCCACAAGAGCCTGCCGGCCGCCGACGCCTTCTTCAAGGGCATGCCGCTCAGGCCTTCCAAGGCGGCCGCCCTTGTGTCAAAGCCCGCCGCAAGATTTGAAGTGAAGGCTTCGTTGAAGGAGAAGGCCGTGGCTGGATTGACCGCCGCCGCATTGACCGCTTCCATGGTTGTTCCCGACGTGGCTGAGGCGGCCAGCGGCGTCTCGCCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987251
ATGGCCTCAACTTCAGCAGTCTCAATGGCCCTGCCGCTGCCCCGTGCCGGCCACAAGAGCCTGCCGGCCGCCGACGCCTTCTTCAAGGGCATGCCGCTCAGGCCTTCCAAGGCGGCCGCCCTTGTGTCAAAGCCCGCCGCAAGATTTGAAGTGAAGGCTTCGTTGAAGGAGAAGGCCGTGGCTGGATTGACCGCCGCCGCATTGACCGCTTCCATGGTTGTTCCCGACGTGGCTGAGGCGGCCAGCGGCGTCTCGCCCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766872.1
MASTSAVSMALPLPRAGHKSLPAADAFFKGMPLRPSKAAALVSKPAARFEVKASLKEKAVAGLTAAALTASMVVPDVAEAASGVSPSLKNFLLSIAAGGVVLTALLGAVIGVSNFDPVKRG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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