当前解析结果
SmilChr01G002827| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002827 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002827 |
| 描述 | bet1-like SNARE 1-1 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 46866506 - 46869638 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130987356 |
|---|---|
| GeneID | 130987356 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130987356 |
| 原始查询 | SmilChr01G002827 |
| 来源 | GFF basic annotation; KEGG smil; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | bet1-like SNARE 1-1 |
| 产物 | bet1-like SNARE 1-1 |
| Arabidopsis | AT3G58170 (BS14A)BET1P/SFT1P-like protein 14A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824986] identity=80.5; qcov=1.01; evalue=7.31e-68; confidence=high |
| Rice | Os02g0820700 (P0474F11.16-2)- identity=78.9; qcov=1.01; evalue=8.01e-65; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | smil04130 (SNARE interactions in vesicular transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130987356 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 0.80000 | XP_057766880.1 |
| 2 | Vacuole | 液泡 | 0.20000 | XP_057766880.1 |
| 3 | Vacuole membrane | 液泡膜 | 0.20000 | XP_057766880.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057766880.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057766880.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:46866741 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B41,B5,B6,B65,B93 |
Chr1:46866745 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B41,B5,B6,B65,B93 |
Chr1:46866762 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B41,B5,B65,B93 |
Chr1:46867771 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B98,C18,C48,C79,D4 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。