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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002830`

染色体: Chr01 坐标: 46901493-46903173 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002830`
名称	SmilChr01G002830
描述	growth-regulating factor 5
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	46901493 - 46903173 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987416`
GeneID	`130987416`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987416`
原始查询	`SmilChr01G002830`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	growth-regulating factor 5
产物	growth-regulating factor 5
Arabidopsis	`AT3G13960` (GRF5) growth-regulating factor 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820609] identity=68.2; qcov=0.43; evalue=3.81e-57; confidence=low
Rice	`Os02g0776900` (GRF1) - identity=72.9; qcov=0.403; evalue=1.77e-52; confidence=low
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006351 (DNA-templated transcription); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0032502 (developmental process)
KEGG	-
Pfam	PF08879 (WRC); PF08880 (QLQ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987416

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766930.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766930.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766930.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766930.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057766930.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:46901929`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C1,C17
`Chr1:46902335`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr1:46902485`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766930.1

293 aa

146

293

QLQ

WRC

PF08880 QLQ 12-46 aa PF08879 WRC 80-122 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766930.1`	Pfam	`PF08880`	QLQ	Domain	12	46	4.1e-16	59.1	QLQ
`XP_057766930.1`	Pfam	`PF08879`	WRC	Domain	80	122	1.8e-21	76.2	WRC

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910947.1
GAGGCAGGAGCTGCCATAAAGGCAGCATAGTTGCAGCAGCAGCAGTGTCAGCAGATGCCCACAGAGCAGCTGCTGCTGCTGCCAGTAGTCATAATATGTGCACAGTACACGCTCAGAGAGAGAAGGAAAGAGAGAGTGTGTTGCAGCAGTGTGATCAGAACCATTAGTTTTTATCCATGTACAGAAGATTCTGCAACTCAAATGGTCCCTGAAATAAATATACCTACTCTGCTATGCATTTACCCCAAGGGCTCTAACTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987416
ATGATGAGTGGTAGTGTGAGAAGTAGTAGGTTCCCTTTTACTGCATCACAATGGCAAGAACTTGAGCATCAAGCTCTGGTTTTCAAGTACATGGTCTCTGGCATGCCCATCCCACCAGATCTCCTCTTCACCATCAGAACTAGTCTGGATTCCTCACTCTCCTCCAAATTCCTCATCCACCAACCCCAACACATTGGATGGAACAGCTTCCACATGGGATTCGGGAGGAAGATCGACCCGGAGCCGGGGCGGTGCCGGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766930.1
MMSGSVRSSRFPFTASQWQELEHQALVFKYMVSGMPIPPDLLFTIRTSLDSSLSSKFLIHQPQHIGWNSFHMGFGRKIDPEPGRCRRTDGKKWRCSKEAYPDSKYCERHMHRGRNRSRKPVEILSPTTAATPRNAHPPSSSSTPISSEPHFLYPHFPSSRPAAADSTNFFLDSRPPLKDFRHGNGIKGENEFFSSDSNPYSSSKLEPLKMELKHNNAAYLSDQSYRQYQHDRYYSAAERAEEQPKKVMHHFLEEWAPKDA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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