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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002838`

染色体: Chr01 坐标: 46970133-46971150 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002838`
名称	SmilChr01G002838
描述	auxin-binding protein ABP20-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	46970133 - 46971150 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987472`
GeneID	`130987472`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987472`
原始查询	`SmilChr01G002838`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	auxin-binding protein ABP20-like
产物	auxin-binding protein ABP20-like
Arabidopsis	`AT5G20630` (GER3) germin 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832185] identity=69; qcov=0.966; evalue=6.55e-95; confidence=high
Rice	`Os08g0460000` (OsGLP1) - identity=67.4; qcov=0.918; evalue=6.66e-93; confidence=high
GO	GO:0005618 (cell wall); GO:0030145 (manganese ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00190 (Cupin_1); PF07883 (Cupin_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987472

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057766992.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766992.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766992.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766992.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766992.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:46970382`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	114	A16,A18,A2,A20,A21,A23,A24,A25,A4,A7,A8,B10,B100,B105,B107,B109,B11,B118,B12,B121,B122,B125,B126,B135,B136,B137,B139,B140,B21,B24,B25,B26,B28,B32,B34,B35,B37,B38,B39,B41,B48,B5,B55,B57,B59,B6,B63,B64,B67,B69,B72,B73,B75,B77,B78,B79,B8,B80,B85,B86,B87,B88,B90,B92,B93,B94,B95,B98,B99,C1,C11,C12,C14,C17,C19,C2,C21,C24,C25,C27,C35,C37,C38,C39,C43,C44,C49,C5,C52,C57,C6,C63,C64,C67,C69,C7,C70,C71,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C84,C86,D11,D2,D5,D8,D9
`Chr1:46970401`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr1:46970476`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C35
`Chr1:46970476`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C35
`Chr1:46970482`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr1:46970566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B13,B140
`Chr1:46970611`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B18,C78,C83
`Chr1:46970701`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B30,C19
`Chr1:46970983`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B104,B12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766992.1

207 aa

104

207

Cupin_1

Cupin_2

PF00190 Cupin_1 51-196 aa PF07883 Cupin_2 87-159 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766992.1`	Pfam	`PF00190`	Cupin_1	Domain	51	196	1.3e-38	132.7	Cupin
`XP_057766992.1`	Pfam	`PF07883`	Cupin_2	Domain	87	159	4.2e-07	30.3	Cupin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911009.1
AGAGGGTTTTTGTTTTGTTGTGAAGAAAAGATCGAAGCAATATCACATGCATCACAGCCCATACCTCGTCTTCTTTTGCATGGTAAAATATCTCGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATCCAATAGGAATATAGGATTATCCCCACGATATCCATCCTCACACATTCTATCTATCTAAACCCTATAAACACTCCCACACTCCCACCAAAACTTACCATAAAAAACTAAGAAGAAAATCCAGAATGCAGCTCACCATCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987472
ATGCAGCTCACCATCCTCTCCCTCCTCCTCCTGGCCGCCGCCACGGACGCCCTCGTGCAGGACTTCTGCGTGGCGGACCTCTCCCTCCCGGCCACCCCCTCCGGCTACCCCTGCAAGAAGAAAGTCACCGAGAAGGACTTCGCCTACAGCGGGCTGGCCGCCCCCGGCAACACCACCAACATCATCGGCGCCGCCGTGGGCCCCGCCTTCGACGCGCAGTTCCCCGGCGTGAACGGGCTGGGCATATCGATCGCGCGGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766992.1
MQLTILSLLLLAAATDALVQDFCVADLSLPATPSGYPCKKKVTEKDFAYSGLAAPGNTTNIIGAAVGPAFDAQFPGVNGLGISIARLDLAVGGVIPMHTHPAGSEILVVIEGTICAGFISSFANTVYLKTLNKGDIMVFPQGLLHFQFNSGKGPALAYVSFGTQNPGLQITDFALFKNDLPTELIAKTTFLDVAQIKKLKAVLGGTN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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