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Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr01G002842

染色体: Chr01 坐标: 46988516-46992084 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr01G002842
名称SmilChr01G002842
描述MOB kinase activator-like 1A
染色体 / SeqIDChr01 / NC_080387.1
坐标与链方向46988516 - 46992084 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130987500
GeneID130987500
locus_tag-
NCBI NameLOC130987500
原始查询SmilChr01G002842

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述MOB kinase activator-like 1A
产物MOB kinase activator-like 1A
ArabidopsisAT5G45550 (MOB1-like)
Mob1/phocein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834591]
identity=81.6; qcov=0.991; evalue=3.12e-134; confidence=high
RiceOs03g0577200
-
identity=83; qcov=0.991; evalue=2.91e-136; confidence=high
GOGO:0001934 (positive regulation of protein phosphorylation); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0007165 (signal transduction); GO:0030295 (protein kinase activator activity)
KEGGsmil04519 (Cadherin signaling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
PfamPF03637 (Mob1_phocein)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130987500

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Cytoplasm 细胞质 1.00000 XP_057767024.1
2 Cytosol 细胞质基质 0.80000 XP_057767028.1
3 Nucleus 细胞核 0.20000 XP_057767076.1
4 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057767076.1
5 Centromere 着丝粒 0.00000 XP_057767076.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr1:46988710 C CCA 2bp_insertion frameshift_variant 114 A14,A15,A16,A20,A21,A3,A5,A8,B1,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B109,B112,B114,B120,B123,B125,B126,B128,B129,B130,B131,B132,B134,B138,B139,B14,B15,B17,B18,B2,B20,B21,B23,B26,B27,B29,B3,B30,B31,B33,B36,B38,B39,B44,B47,B49,B50,B53,B56,B60,B61,B63,B64,B65,B66,B7,B70,B73,B76,B79,B80,B83,B84,B89,B93,B96,B97,C10,C12,C13,C14,C16,C17,C18,C19,C20,C26,C28,C3,C30,C31,C32,C34,C35,C38,C4,C40,C41,C42,C5,C52,C53,C55,C59,C60,C61,C62,C68,C74,C76,C78,C83,C85,D1,D11,D2,D4,D6,D7
Chr1:46989124 GT G 1bp_deletion frameshift_variant 1 B123
Chr1:46989124 GT G 1bp_deletion CDS_variant 1 B123
Chr1:46989145 GT G 1bp_deletion frameshift_variant 1 B104
Chr1:46989145 GT G 1bp_deletion CDS_variant 1 B104
Chr1:46989159 G GTT 2bp_insertion frameshift_variant 2 A23,B32
Chr1:46989159 G GTT 2bp_insertion CDS_variant 2 A23,B32
Chr1:46989165 C CT 1bp_insertion frameshift_variant 97 A1,A14,A18,A19,A2,A22,A24,A4,A7,A9,B10,B100,B104,B108,B110,B112,B113,B115,B119,B12,B122,B124,B127,B129,B130,B131,B133,B137,B138,B14,B19,B22,B23,B33,B34,B35,B4,B41,B42,B43,B45,B52,B53,B57,B6,B64,B67,B68,B71,B78,B79,B8,B81,B83,B84,B85,B90,B92,B99,C1,C17,C18,C2,C20,C22,C23,C25,C27,C29,C32,C34,C35,C36,C43,C46,C48,C50,C52,C56,C57,C60,C61,C64,C66,C68,C7,C70,C72,C76,C85,C86,C87,C9,D10,D3,D4,D9
Chr1:46991553 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B1,B82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767024.1
257 aa
N
1
128
257
Mob1_phocein
C
PF03637 Mob1_phocein 77-246 aa
XP_057767028.1
250 aa
N
1
125
250
Mob1_phocein
C
PF03637 Mob1_phocein 70-239 aa
XP_057767037.1
235 aa
N
1
118
235
Mob1_phocein
C
PF03637 Mob1_phocein 55-224 aa
XP_057767042.1
235 aa
N
1
118
235
Mob1_phocein
C
PF03637 Mob1_phocein 55-224 aa
XP_057767050.1
235 aa
N
1
118
235
Mob1_phocein
C
PF03637 Mob1_phocein 55-224 aa
XP_057767058.1
231 aa
N
1
116
231
Mob1_phocein
C
PF03637 Mob1_phocein 51-220 aa
XP_057767070.1
228 aa
N
1
114
228
Mob1_phocein
C
PF03637 Mob1_phocein 48-217 aa
XP_057767076.1
224 aa
N
1
112
224
Mob1_phocein
C
PF03637 Mob1_phocein 44-213 aa
XP_057767084.1
214 aa
N
1
107
214
Mob1_phocein
C
PF03637 Mob1_phocein 34-203 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057767024.1 Pfam PF03637 Mob1_phocein Family 77 246 6.1e-78 261.4 Mob1/phocein family
XP_057767028.1 Pfam PF03637 Mob1_phocein Family 70 239 5.6e-78 261.5 Mob1/phocein family
XP_057767037.1 Pfam PF03637 Mob1_phocein Family 55 224 4.5e-78 261.8 Mob1/phocein family
XP_057767042.1 Pfam PF03637 Mob1_phocein Family 55 224 4.5e-78 261.8 Mob1/phocein family
XP_057767050.1 Pfam PF03637 Mob1_phocein Family 55 224 4.5e-78 261.8 Mob1/phocein family
XP_057767058.1 Pfam PF03637 Mob1_phocein Family 51 220 4.4e-78 261.9 Mob1/phocein family
XP_057767070.1 Pfam PF03637 Mob1_phocein Family 48 217 4.2e-78 261.9 Mob1/phocein family
XP_057767076.1 Pfam PF03637 Mob1_phocein Family 44 213 4e-78 262.0 Mob1/phocein family
XP_057767084.1 Pfam PF03637 Mob1_phocein Family 34 203 3.5e-78 262.2 Mob1/phocein family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

9 records

下载 cDNA FASTA
XM_057911093.1
TGGGGAATTAATAATTGAAAGCTAGGAAAGCCAATAATAGAAAAAATTCCATCTCATATAAGAATAATACTAATTCAAACAAGAATGGTGAGAGAAAGAAAAGGCAAAATCCGATGTTGGATATGGATTCCTGGGCAGAGACTTTCAGTCAGAAATGAAGAGAGAGAGAGGAGTTTGGCAGCAACCTGAACTCTTCAATGCCAGTCTAAGCCAGAAGACTTTTCGCTCGAGAAAAGGTTCTCCTTCTGGAATTAAGAGTC...
XM_057911087.1
TATAAGAATAATACTAATTCAAACAAGAATGGTGAGAGAAAGAAAAGGCAAAATCCGATGTTGGATATGGATTCCTGGGCAGAGACTTTCAGTCAGAAATGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAGTTTGGCAGCAACCTGAACTCTTCAATGCCAGTCTAAGCCAGAAGACTTTTCGCTCGAGAAAAGGTTCTCCTTCTGGAATTAAGAGTCTGCAGCTCAGGAAGCATATCGATTCGACCTTGGGCAGTGGCAAC...

CDS

9 records

下载 CDS FASTA
LOC130987500
ATGGTGAGAGAAAGAAAAGGCAAAATCCGATGTTGGATATGGATTCCTGGGCAGAGACTTTCAGTCAGAAATGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAGTTTGGCAGCAACCTGAACTCTTCAATGCCAGTCTAAGCCAGAAGACTTTTCGCTCGAGAAAAGGTTCTCCTTCTGGAATTAAGAGTCTGCAGCTCAGGAAGCATATCGATTCGACCTTGGGCAGTGGCAACTTGAGGGAAGCTGTAAGGCTTCCCCCAGGAGA...
LOC130987500
ATGGTGAGAGAAAGAAAAGGCAAAATCCGATGTTGGATATGGATTCCTGGGCAGAGACTTTCAGTCAGAAATGAAAGCCAGAAGACTTTTCGCTCGAGAAAAGGTTCTCCTTCTGGAATTAAGAGTCTGCAGCTCAGGAAGCATATCGATTCGACCTTGGGCAGTGGCAACTTGAGGGAAGCTGTAAGGCTTCCCCCAGGAGAGGATATTAATGAGTGGTGGGCAGTAAATACTGTCGACTTTTTCAACCAAGTGACCAT...

Protein

9 records

下载 Protein FASTA
XP_057767024.1
MSKRICQRSCLLLPTLLTYEPSLTWICIYAERERERERGVWQQPELFNASLSQKTFRSRKGSPSGIKSLQLRKHIDSTLGSGNLREAVRLPPGEDINEWWAVNTVDFFNQVTILYGTLTEFCTPTTCPIMSAGPKYEYRWADGVTIKKPIVVSAPKYVEYLMDWIEVQLDDESIFPQKLGVPFPPNFHDVVKTILKRLFRVYAHIYHSHFQRIVSLEEEAHLNTCFKHFVLFTSEFGLIEKAELAALGDIVESILQS
XP_057767028.1
MVRERKGKIRCWIWIPGQRLSVRNEERERERGVWQQPELFNASLSQKTFRSRKGSPSGIKSLQLRKHIDSTLGSGNLREAVRLPPGEDINEWWAVNTVDFFNQVTILYGTLTEFCTPTTCPIMSAGPKYEYRWADGVTIKKPIVVSAPKYVEYLMDWIEVQLDDESIFPQKLGVPFPPNFHDVVKTILKRLFRVYAHIYHSHFQRIVSLEEEAHLNTCFKHFVLFTSEFGLIEKAELAALGDIVESILQS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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