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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002849`

染色体: Chr01 坐标: 47059151-47067780 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002849`
名称	SmilChr01G002849
描述	protein FIP1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	47059151 - 47067780 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987600`
GeneID	`130987600`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987600`
原始查询	`SmilChr01G002849`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FIP1-like
产物	protein FIP1-like
Arabidopsis	`AT2G06005` (FIP1) FRIGIDA interacting protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815154] identity=75.2; qcov=0.938; evalue=3.56e-162; confidence=high
Rice	`Os02g0778300` (OJ1534_E09.24-1) - identity=66; qcov=0.941; evalue=3.39e-141; confidence=high
GO	GO:0005765 (lysosomal membrane); GO:0005770 (late endosome)
KEGG	-
Pfam	PF14802 (TMEM192)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987600

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057767180.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057767180.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.40000	`XP_057767180.1`
4	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.20000	`XP_057767174.1`
5	Endosome	内体	0.20000	`XP_057767174.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:47059639`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B13,B140
`Chr1:47061390`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,A7,C16,C61
`Chr1:47061737`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	56	A11,A13,A15,A19,A22,A25,A3,A5,B100,B102,B103,B106,B108,B128,B135,B21,B24,B26,B31,B32,B37,B40,B41,B5,B58,B59,B66,B68,B7,B73,B81,B87,B95,B98,C1,C17,C20,C29,C32,C33,C35,C37,C4,C47,C49,C5,C53,C63,C68,C70,C76,C78,C82,D1,D11,D5
`Chr1:47061748`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A20,B137,B33,B79,C36
`Chr1:47061748`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B137,B33,B79,C36
`Chr1:47061782`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr1:47061784`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	B122,B126,B18,B30,B84,B87,C19,C27,C30,C36,C41
`Chr1:47065652`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B84
`Chr1:47065652`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B84
`Chr1:47066692`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B29,B74,C44,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767174.1

352 aa

176

352

TMEM192

PF14802 TMEM192 69-230 aa

XP_057767180.1

322 aa

161

322

TMEM192

PF14802 TMEM192 41-200 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767174.1`	Pfam	`PF14802`	TMEM192	Family	69	230	1.8e-13	50.9	TMEM192 family
`XP_057767180.1`	Pfam	`PF14802`	TMEM192	Family	41	200	1.1e-13	51.7	TMEM192 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911191.1
CTCAAAAAAAACTTTATATACGTATAAAACACACAATAAACATTACATAAATAATTGCTTAAATTCTCATTAAAATCGTTTGTCAAACACAGTCTGTTTTGCAGAGGTATAAATTAACAGATTCCGCCTGAGAAGAAAACAGTCGGCGGAGAGATCGGATAAGGAAAGAAAATTCAGCTCAAAATCCGGCGAGAAACCCATGAGTTGGCCGATTAAACTCGCCAACAACTAAGAATTTCTCTTCAAAAATGTCGATGGAC...

XM_057911197.1
GTTCCTTGACATACTGCAAGAAGCTCCCTTATGTGGTCACCGGAAGCGAACGAGGATACTTGGAAGTATCTTTTATTGTATTTTATTGGTTATGCAATTTTTGCTGTGGGAGTTACCTGGATTCTTCAGTCTTTGGAAGAATTAATTGTCTCACTACTCTGTAGCTGCAATGTCATTCTTTTGGCCGTTACAGGCATTTTTCAACAATATTTGGTTTACCAAGTTCAGAAGATACGCCTACAGGGTTATTATGGTTTCAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130987600
ATGTCGATGGACAGGCACGGTTCTTCCTTCGTTGCATCTCCCGAAGAAACCAACCTGTTCCTTGACATACTGCAAGAAGCTCCCTTATGTGGTCACCGGAAGCGAACGAGGATACTTGGAAGTATCTTTTATTGTATTTTATTGGCAAGTTATGCAATTTTTGCTGTGGGAGTTACCTGGATTCTTCAGTCTTTGGAAGAATTAATTGTCTCACTACTCTGTAGCTGCAATGTCATTCTTTTGGCCGTTACAGGCATTTT...

LOC130987600
ATGTGGTCACCGGAAGCGAACGAGGATACTTGGAAGTATCTTTTATTGTATTTTATTGGTTATGCAATTTTTGCTGTGGGAGTTACCTGGATTCTTCAGTCTTTGGAAGAATTAATTGTCTCACTACTCTGTAGCTGCAATGTCATTCTTTTGGCCGTTACAGGCATTTTTCAACAATATTTGGTTTACCAAGTTCAGAAGATACGCCTACAGGGTTATTATGGTTTCAGCCAAAAGTTGAAGCATATAATTCGCCTACC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057767174.1
MSMDRHGSSFVASPEETNLFLDILQEAPLCGHRKRTRILGSIFYCILLASYAIFAVGVTWILQSLEELIVSLLCSCNVILLAVTGIFQQYLVYQVQKIRLQGYYGFSQKLKHIIRLPFATIAYGTAAMLLVMAWKHHISFLSISMLLRIIMLVEAVCAGFFMSIYIGYVHQYNSLDSQPDVLNSLYSPLQQSSPLEGLRYHDGGRLSDQQMALLQYQRENLHFLSEEILRLQECLSKYERTDDGSTPQVDLAHLLATRDQ...

XP_057767180.1
MWSPEANEDTWKYLLLYFIGYAIFAVGVTWILQSLEELIVSLLCSCNVILLAVTGIFQQYLVYQVQKIRLQGYYGFSQKLKHIIRLPFATIAYGTAAMLLVMAWKHHISFLSISMLLRIIMLVEAVCAGFFMSIYIGYVHQYNSLDSQPDVLNSLYSPLQQSSPLEGLRYHDGGRLSDQQMALLQYQRENLHFLSEEILRLQECLSKYERTDDGSTPQVDLAHLLATRDQELRTLSAEMNQLQSELRLARSLIAERDSEI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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