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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002854`

染色体: Chr01 坐标: 47126960-47128486 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002854`
名称	SmilChr01G002854
描述	uncharacterized SmilChr01G002854
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	47126960 - 47128486 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008993`
GeneID	`131008993`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008993`
原始查询	`SmilChr01G002854`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0357300; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os04g0357300; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G51700` (AT3G51700) PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824333] identity=42.9; qcov=0.585; evalue=2.02e-48; confidence=medium
Rice	`Os04g0357300` - identity=47.9; qcov=0.482; evalue=2.71e-57; confidence=medium
GO	GO:0000723 (telomere maintenance); GO:0003678 (DNA helicase activity); GO:0006281 (DNA repair)
KEGG	-
Pfam	PF05970 (PIF1); PF21530 (Pif1_2B_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008993

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792143.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057792143.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792143.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792143.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792143.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:47126961`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	A6,B30,B51,B55
`Chr1:47126961`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	A6,B30,B51,B55
`Chr1:47126987`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:47127028`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B15,B85,B94,C14,D7
`Chr1:47127044`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	51	B102,B109,B11,B110,B114,B127,B129,B131,B136,B139,B15,B21,B25,B37,B47,B50,B52,B53,B54,B7,B70,B73,B76,B83,B85,B88,B90,B92,B94,B97,C1,C11,C15,C17,C21,C28,C3,C31,C4,C43,C52,C65,C69,C71,C79,C81,C82,C87,D3,D4,D9
`Chr1:47127047`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr1:47127069`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B107,B86,C31,C9
`Chr1:47127158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr1:47127194`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B131,B46,B53
`Chr1:47127199`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	40	A19,B100,B109,B110,B127,B131,B136,B139,B29,B47,B48,B50,B52,B54,B7,B70,B73,B74,B83,B85,B90,B92,B97,C11,C15,C16,C17,C21,C27,C3,C4,C43,C44,C52,C69,C77,C79,C87,D4,D5
`Chr1:47127202`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr1:47127250`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	22	A20,A8,B106,B119,B36,B48,B49,B56,B65,B79,B89,B95,C12,C22,C36,C54,C55,C62,C64,C65,C80,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792143.1

386 aa

193

386

PIF1

Pif1_2B_dom

PF05970 PIF1 26-207 aa PF21530 Pif1_2B_dom 222-268 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792143.1`	Pfam	`PF05970`	PIF1	Family	26	207	1.7e-80	270.5	PIF1-like helicase
`XP_057792143.1`	Pfam	`PF21530`	Pif1_2B_dom	Domain	222	268	5.1e-21	74.8	DNA helicase Pif1, 2B domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936160.1
ATGAGTGTTATCAGTGATGAGTTGGAGTATGATAAAGAATCTTTGGCAAGAGAGCATGTTCAATTTGTTTCAAAGTTCAATGATGAGCAACGTTGTGTGTATGATGTGATAATGAAATATGTTGAATCAAAAAATAGTGGGCTGTTCTTTGTGTATGGATATGGAGGTACTGGCAAAACATTTCTTTGGAAGTCATTGTCTGCTGGAATACGTTGTAAAGGAGAAATTGTGATTAATGTTGCTTCAAGTGGTATTGCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008993
ATGAGTGTTATCAGTGATGAGTTGGAGTATGATAAAGAATCTTTGGCAAGAGAGCATGTTCAATTTGTTTCAAAGTTCAATGATGAGCAACGTTGTGTGTATGATGTGATAATGAAATATGTTGAATCAAAAAATAGTGGGCTGTTCTTTGTGTATGGATATGGAGGTACTGGCAAAACATTTCTTTGGAAGTCATTGTCTGCTGGAATACGTTGTAAAGGAGAAATTGTGATTAATGTTGCTTCAAGTGGTATTGCTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792143.1
MSVISDELEYDKESLAREHVQFVSKFNDEQRCVYDVIMKYVESKNSGLFFVYGYGGTGKTFLWKSLSAGIRCKGEIVINVASSGIASLLLPGGRTAHSRFKIPINVSEDSVCNIKQGSELAELIIIAKLIIWDEAPMMHKHCFEALDRTLRDLMRFTNASSFELPYGGKTVVFGGDFRQILPVICKGSRQDVVNTTINSSYLWEKCKSSSNSNGNEELHTQEFLNTLRCSGTPNHEKVLKVGSPVMLLRNIDPGNGLCNG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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