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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002863`

染色体: Chr01 坐标: 47222088-47227943 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002863`
名称	SmilChr01G002863
描述	uncharacterized SmilChr01G002863
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	47222088 - 47227943 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987706`
GeneID	`130987706`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987706`
原始查询	`SmilChr01G002863`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquinone biosynthesis COQ9-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838497]; symbol=AT1G19140; hit=AT1G19140; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ubiquinone biosynthesis COQ9-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838497]; symbol=AT1G19140; hit=AT1G19140; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G19140` (AT1G19140) ubiquinone biosynthesis COQ9-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838497] identity=60; qcov=0.969; evalue=1.41e-118; confidence=high
Rice	`Os03g0405100` - identity=72.8; qcov=0.675; evalue=1.01e-104; confidence=high
GO	GO:0005743 (mitochondrial inner membrane); GO:0006744 (ubiquinone biosynthetic process); GO:0008289 (lipid binding)
KEGG	-
Pfam	PF08511 (COQ9)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987706

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057767321.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057767321.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057767321.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767321.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767321.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:47222267`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr1:47222382`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:47222429`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C23
`Chr1:47222436`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:47222489`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr1:47222496`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B75
`Chr1:47223933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B128,B132,B15
`Chr1:47223959`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C83
`Chr1:47223962`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B13,B140,B93
`Chr1:47224072`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B130,C34
`Chr1:47224656`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr1:47224708`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767321.1

291 aa

146

291

COQ9

PF08511 COQ9 190-258 aa

XP_057767327.1

289 aa

144

289

COQ9

PF08511 COQ9 190-258 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767321.1`	Pfam	`PF08511`	COQ9	Domain	190	258	2.3e-27	95.2	COQ9
`XP_057767327.1`	Pfam	`PF08511`	COQ9	Domain	190	258	2.1e-27	95.3	COQ9

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911338.1
AGGCCTTGTAATAATGCTTGAATTTGGGTGGCACACTCTTTCGCCTTCTAAATACTCCGCAGACTTGCTTGCACAACACAAGTGCTTACGTGGCTTTACTAAATTCCACTACTAGCCATCTCAATTAACTCTATGTACCGATCGGCGGCGAGGCGGCTGTTGCCGGCGGTGATCTGCCGGCGCCCTCTTCGATTACGCTCTCCTGCTCCTTTCGCAGCCCCAATCGAACACCGGGCGTCGTTTTCAGCGGACGCCGCCGA...

XM_057911344.1
AGGCCTTGTAATAATGCTTGAATTTGGGTGGCACACTCTTTCGCCTTCTAAATACTCCGCAGACTTGCTTGCACAACACAAGTGCTTACGTGGCTTTACTAAATTCCACTACTAGCCATCTCAATTAACTCTATGTACCGATCGGCGGCGAGGCGGCTGTTGCCGGCGGTGATCTGCCGGCGCCCTCTTCGATTACGCTCTCCTGCTCCTTTCGCAGCCCCAATCGAACACCGGGCGTCGTTTTCAGCGGACGCCGCCGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130987706
ATGTACCGATCGGCGGCGAGGCGGCTGTTGCCGGCGGTGATCTGCCGGCGCCCTCTTCGATTACGCTCTCCTGCTCCTTTCGCAGCCCCAATCGAACACCGGGCGTCGTTTTCAGCGGACGCCGCCGAGAACGCTCAAAATCACAACCCTCGCAATGCCGCTGCTTTCAATTCGTCGTCGTCGTCAGATGAAGGGCGGAACCCTAGAGCCACGGCTCGCCCCAAAGCTCACTGGCAGGAAGAGCAGGCGCGTGTTCTTCA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057767321.1
MYRSAARRLLPAVICRRPLRLRSPAPFAAPIEHRASFSADAAENAQNHNPRNAAAFNSSSSSDEGRNPRATARPKAHWQEEQARVLQASLRHVLRVGWTDAAMIAGAREVGISPSVVGSFPRKEAALVEFFMDDCLQKLIDIIDTKEDLKNLIPSHRVSKLVRIRLEMQAPYISKWPQALSIQAQPLNISTSFKQRAMLVDEIWHAAGDEGSDTDWYVKRTVLGGIYSTTELYMLTDTSADFQGTWAFLDERVRDAFDMK...

XP_057767327.1
MYRSAARRLLPAVICRRPLRLRSPAPFAAPIEHRASFSADAAENAQNHNPRNAAAFNSSSSSDEGRNPRATARPKAHWQEEQARVLQASLRHVLRVGWTDAAMIAGAREVGISPSVVGSFPRKEAALVEFFMDDCLQKLIDIIDTKEDLKNLIPSHRVSKLVRIRLEMQAPYISKWPQALSIQAQPLNISTSFKQRAMLVDEIWHAAGDEGSDTDWYVKRTVLGGIYSTTELYMLTDTSADFQGTWAFLDERVRDAFDMK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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