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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002871`

染色体: Chr01 坐标: 47313474-47314909 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002871`
名称	SmilChr01G002871
描述	protein LURP-one-related 6-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	47313474 - 47314909 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987803`
GeneID	`130987803`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987803`
原始查询	`SmilChr01G002871`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein LURP-one-related 6-like
产物	protein LURP-one-related 6-like
Arabidopsis	`AT2G05910` (AT2G05910) LURP-one-like protein (DUF567) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815143] identity=54; qcov=0.961; evalue=3.41e-69; confidence=high
Rice	`Os03g0179700` (OSJNBa0050H14.13) - identity=46.6; qcov=1; evalue=3.54e-65; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04525 (LOR)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987803

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057767472.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057767472.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057767472.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767472.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767472.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:47313824`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B130,C23
`Chr1:47313837`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr1:47314009`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:47314338`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	193	A10,A11,A13,A14,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A24,A3,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B10,B100,B101,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B111,B113,B115,B117,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B125,B128,B129,B13,B130,B131,B133,B134,B135,B137,B14,B140,B16,B17,B19,B2,B20,B21,B22,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B33,B35,B36,B37,B38,B4,B40,B41,B45,B46,B48,B49,B50,B51,B52,B53,B54,B56,B58,B6,B61,B62,B64,B65,B67,B68,B69,B7,B71,B72,B74,B75,B77,B78,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B94,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C2,C22,C23,C25,C26,C27,C28,C29,C30,C32,C33,C34,C35,C37,C38,C39,C4,C42,C43,C44,C45,C48,C49,C5,C50,C52,C53,C55,C58,C59,C6,C60,C61,C63,C64,C65,C66,C67,C69,C70,C71,C72,C73,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D8,D9
`Chr1:47314389`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr1:47314428`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C53
`Chr1:47314440`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr1:47314443`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr1:47314499`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767472.1

206 aa

103

206

LOR

PF04525 LOR 22-197 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767472.1`	Pfam	`PF04525`	LOR	Domain	22	197	8.1e-28	98.7	LURP-one-related

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911489.1
TTAAAACCAGACGTTCGTAATCGTGCCGTATCGTTATCATTACCATTATCATTAATATTTCAAAAGAATTTAGTTATTGTTTCTGCAGTGTCCGAAGTGAAATTTGAGACCATATTTCCAATTATGCAACGCTTTTCTATTTCCACGTATTTAGCAACGTATACTCAAAATTAGTTTTCATACTGTATTTCAACACTGAAACGAGATTCGTTTGTGGCACAAATAGTCAAAAAGGATTATTGCCAAACTCCATCGAATAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987803
ATGGCTACAAAGAAAACTGTGTTACCAATTGTGAGCAAAGTCTACTGTGCACCTACCGAGGTGGTCCTCGCCGTGAGGCGGCGGCCCAACGTGGCCAACGGTGGCGGCTTCGTGGTGGCCGACCCGACCCAACGGATCGTGTTTCGCGTCGACGGCTGCGGAGTCCTCGGCAAGAAAGATGAACTCATTCTCAGAGATGGAGATGGAAATGCTCTGCTGCTCATCAGGCGTAAGGGAGGAACAATTGAGGCACTAAGCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767472.1
MATKKTVLPIVSKVYCAPTEVVLAVRRRPNVANGGGFVVADPTQRIVFRVDGCGVLGKKDELILRDGDGNALLLIRRKGGTIEALSLTRKWKGFAYDFVGSDKLVFTLKEPNSCFSGQNRIRISIESKELCSHGSFEVHGDFPGRSCTVVSPMGDVVALIGVNKELQRLMRSRDMYHVEIKAGFDQAFVFGVIAVLDYIYDGSTRC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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